Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HERVK_113P62684 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HERVK_113P62684 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HERVK_113P62684 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HERVK_113P62684 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HERVK_113P62684 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HERVK_113P62684 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HERVK_113P62684 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HERVK_113P62684 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HERVK_113P62684 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HERVK_113P62684 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HERVK_113P62684 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HERVK_113P62684 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HERVK_113P62684 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
HERVK_113P62684 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HERVK_113P62684 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HERVK_113P62684 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
HERVK_113P62684 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HERVK_113P62684 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HERVK_113P62684 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HERVK_113P62684 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HERVK_113P62684 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HERVK_113P62684 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HERVK_113P62684 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HERVK_113P62684 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HERVK_113P62684 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HERVK_113P62684 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HERVK_113P62684 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HERVK_113P62684 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HERVK_113P62684 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HERVK_113P62684 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HERVK_113P62684 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HERVK_113P62684 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HERVK_113P62684 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HERVK_113P62684 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HERVK_113P62684 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HERVK_113P62684 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HERVK_113P62684 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HERVK_113P62684 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HERVK_113P62684 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
HERVK_113P62684 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HERVK_113P62684 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HERVK_113P62684 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HERVK_113P62684 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HERVK_113P62684 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HERVK_113P62684 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HERVK_113P62684 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HERVK_113P62684 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HERVK_113P62684 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HERVK_113P62684 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HERVK_113P62684 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HERVK_113P62684 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
HERVK_113P62684 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HERVK_113P62684 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
HERVK_113P62684 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HERVK_113P62684 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
HERVK_113P62684 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HERVK_113P62684 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HERVK_113P62684 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HERVK_113P62684 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HERVK_113P62684 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HERVK_113P62684 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HERVK_113P62684 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HERVK_113P62684 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HERVK_113P62684 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HERVK_113P62684 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HERVK_113P62684 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HERVK_113P62684 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HERVK_113P62684 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
HERVK_113P62684 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HERVK_113P62684 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HERVK_113P62684 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HERVK_113P62684 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HERVK_113P62684 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HERVK_113P62684 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HERVK_113P62684 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HERVK_113P62684 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HERVK_113P62684 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
HERVK_113P62684 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HERVK_113P62684 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HERVK_113P62684 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HERVK_113P62684 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HERVK_113P62684 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HERVK_113P62684 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HERVK_113P62684 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HERVK_113P62684 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HERVK_113P62684 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HERVK_113P62684 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HERVK_113P62684 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HERVK_113P62684 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HERVK_113P62684 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HERVK_113P62684 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HERVK_113P62684 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HERVK_113P62684 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HERVK_113P62684 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HERVK_113P62684 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HERVK_113P62684 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HERVK_113P62684 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HERVK_113P62684 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HERVK_113P62684 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms