Protein–RNA interactions for Protein: P55036

PSMD4, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD4P55036 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMD4P55036 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMD4P55036 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMD4P55036 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMD4P55036 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMD4P55036 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PSMD4P55036 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PSMD4P55036 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PSMD4P55036 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PSMD4P55036 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PSMD4P55036 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PSMD4P55036 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMD4P55036 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMD4P55036 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMD4P55036 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMD4P55036 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMD4P55036 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMD4P55036 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMD4P55036 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMD4P55036 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMD4P55036 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMD4P55036 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMD4P55036 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMD4P55036 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMD4P55036 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMD4P55036 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMD4P55036 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMD4P55036 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMD4P55036 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMD4P55036 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSMD4P55036 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSMD4P55036 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
PSMD4P55036 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PSMD4P55036 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PSMD4P55036 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PSMD4P55036 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSMD4P55036 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PSMD4P55036 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSMD4P55036 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSMD4P55036 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSMD4P55036 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSMD4P55036 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSMD4P55036 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMD4P55036 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMD4P55036 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMD4P55036 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMD4P55036 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMD4P55036 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMD4P55036 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMD4P55036 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMD4P55036 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMD4P55036 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMD4P55036 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMD4P55036 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMD4P55036 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMD4P55036 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMD4P55036 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMD4P55036 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMD4P55036 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSMD4P55036 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSMD4P55036 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSMD4P55036 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSMD4P55036 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSMD4P55036 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PSMD4P55036 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSMD4P55036 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSMD4P55036 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PSMD4P55036 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSMD4P55036 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSMD4P55036 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSMD4P55036 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSMD4P55036 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSMD4P55036 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSMD4P55036 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSMD4P55036 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMD4P55036 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMD4P55036 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMD4P55036 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMD4P55036 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMD4P55036 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMD4P55036 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMD4P55036 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMD4P55036 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMD4P55036 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMD4P55036 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMD4P55036 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMD4P55036 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMD4P55036 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMD4P55036 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMD4P55036 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMD4P55036 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMD4P55036 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMD4P55036 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMD4P55036 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMD4P55036 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMD4P55036 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMD4P55036 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMD4P55036 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMD4P55036 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMD4P55036 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms