Protein–RNA interactions for Protein: P50228

Cxcl5, C-X-C motif chemokine 5, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl5P50228 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cxcl5P50228 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cxcl5P50228 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cxcl5P50228 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cxcl5P50228 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cxcl5P50228 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cxcl5P50228 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cxcl5P50228 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxcl5P50228 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxcl5P50228 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxcl5P50228 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxcl5P50228 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxcl5P50228 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxcl5P50228 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxcl5P50228 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxcl5P50228 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxcl5P50228 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxcl5P50228 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxcl5P50228 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxcl5P50228 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxcl5P50228 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxcl5P50228 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxcl5P50228 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxcl5P50228 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxcl5P50228 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxcl5P50228 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxcl5P50228 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxcl5P50228 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxcl5P50228 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxcl5P50228 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxcl5P50228 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxcl5P50228 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxcl5P50228 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxcl5P50228 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxcl5P50228 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxcl5P50228 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxcl5P50228 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxcl5P50228 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxcl5P50228 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxcl5P50228 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcl5P50228 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcl5P50228 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcl5P50228 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcl5P50228 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcl5P50228 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcl5P50228 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcl5P50228 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cxcl5P50228 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxcl5P50228 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxcl5P50228 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxcl5P50228 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxcl5P50228 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxcl5P50228 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxcl5P50228 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxcl5P50228 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxcl5P50228 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxcl5P50228 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxcl5P50228 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxcl5P50228 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxcl5P50228 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxcl5P50228 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxcl5P50228 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cxcl5P50228 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxcl5P50228 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxcl5P50228 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxcl5P50228 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxcl5P50228 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxcl5P50228 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxcl5P50228 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxcl5P50228 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxcl5P50228 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxcl5P50228 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxcl5P50228 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxcl5P50228 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxcl5P50228 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cxcl5P50228 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcl5P50228 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcl5P50228 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcl5P50228 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcl5P50228 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcl5P50228 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcl5P50228 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcl5P50228 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcl5P50228 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcl5P50228 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcl5P50228 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcl5P50228 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcl5P50228 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcl5P50228 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcl5P50228 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcl5P50228 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cxcl5P50228 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cxcl5P50228 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cxcl5P50228 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxcl5P50228 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxcl5P50228 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxcl5P50228 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxcl5P50228 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxcl5P50228 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxcl5P50228 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms