Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FNTAP49354 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FNTAP49354 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FNTAP49354 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FNTAP49354 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FNTAP49354 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FNTAP49354 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FNTAP49354 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FNTAP49354 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FNTAP49354 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FNTAP49354 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FNTAP49354 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FNTAP49354 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FNTAP49354 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FNTAP49354 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FNTAP49354 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FNTAP49354 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FNTAP49354 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FNTAP49354 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FNTAP49354 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FNTAP49354 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FNTAP49354 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FNTAP49354 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FNTAP49354 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FNTAP49354 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FNTAP49354 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FNTAP49354 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FNTAP49354 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FNTAP49354 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FNTAP49354 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FNTAP49354 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FNTAP49354 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FNTAP49354 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FNTAP49354 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FNTAP49354 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FNTAP49354 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FNTAP49354 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FNTAP49354 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FNTAP49354 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FNTAP49354 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FNTAP49354 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FNTAP49354 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FNTAP49354 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FNTAP49354 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FNTAP49354 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FNTAP49354 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FNTAP49354 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FNTAP49354 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FNTAP49354 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FNTAP49354 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FNTAP49354 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FNTAP49354 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FNTAP49354 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FNTAP49354 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FNTAP49354 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FNTAP49354 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FNTAP49354 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FNTAP49354 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FNTAP49354 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FNTAP49354 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FNTAP49354 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FNTAP49354 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FNTAP49354 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FNTAP49354 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FNTAP49354 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FNTAP49354 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FNTAP49354 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FNTAP49354 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FNTAP49354 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FNTAP49354 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FNTAP49354 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FNTAP49354 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FNTAP49354 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FNTAP49354 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FNTAP49354 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FNTAP49354 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FNTAP49354 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FNTAP49354 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FNTAP49354 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FNTAP49354 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FNTAP49354 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FNTAP49354 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FNTAP49354 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FNTAP49354 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FNTAP49354 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FNTAP49354 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FNTAP49354 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FNTAP49354 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FNTAP49354 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FNTAP49354 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FNTAP49354 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FNTAP49354 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FNTAP49354 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FNTAP49354 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FNTAP49354 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FNTAP49354 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FNTAP49354 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FNTAP49354 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FNTAP49354 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FNTAP49354 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms