Protein–RNA interactions for Protein: P40202

CCS1, Superoxide dismutase 1 copper chaperone, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CCS1P40202 YJL175WYJL175W 513 nt2.58□□□□□ -2
CCS1P40202 SDH3YKL141W 597 nt2.58□□□□□ -2
CCS1P40202 OST6YML019W 999 nt2.58□□□□□ -2
CCS1P40202 OXR1YPL196W 822 nt2.58□□□□□ -2
CCS1P40202 COM2YER130C 1332 nt2.58□□□□□ -2
CCS1P40202 UBP12YJL197W 3765 nt2.57□□□□□ -2
CCS1P40202 STP2YHR006W 1626 nt2.57□□□□□ -2
CCS1P40202 ENA5YDR038C 3276 nt2.57□□□□□ -2
CCS1P40202 ACK1YDL203C 1872 nt2.57□□□□□ -2
CCS1P40202 EXO70YJL085W 1872 nt2.57□□□□□ -2
CCS1P40202 QCR10YHR001W-A 234 nt2.57□□□□□ -2
CCS1P40202 YIL025CYIL025C 375 nt2.57□□□□□ -2
CCS1P40202 PHD1YKL043W 1101 nt2.57□□□□□ -2
CCS1P40202 RPL13BYMR142C 600 nt2.57□□□□□ -2
CCS1P40202 RIB5YBR256C 717 nt2.57□□□□□ -2
CCS1P40202 YBR300CYBR300C 498 nt2.57□□□□□ -2
CCS1P40202 YIL092WYIL092W 1902 nt2.57□□□□□ -2
CCS1P40202 NMD2YHR077C 3270 nt2.57□□□□□ -2
CCS1P40202 TIF4631YGR162W 2859 nt2.57□□□□□ -2
CCS1P40202 BUD6YLR319C 2367 nt2.57□□□□□ -2
CCS1P40202 TSC11YER093C 4293 nt2.56□□□□□ -2
CCS1P40202 VPS33YLR396C 2076 nt2.56□□□□□ -2
CCS1P40202 PAM1YDR251W 2493 nt2.56□□□□□ -2
CCS1P40202 YCL075WYCL075W 441 nt2.56□□□□□ -2
CCS1P40202 IMG2YCR071C 441 nt2.56□□□□□ -2
CCS1P40202 YHL005CYHL005C 393 nt2.56□□□□□ -2
CCS1P40202 SPO12YHR152W 522 nt2.56□□□□□ -2
CCS1P40202 PIR1YKL164C 1026 nt2.56□□□□□ -2
CCS1P40202 YLR154C-HYLR154C-H 132 nt2.56□□□□□ -2
CCS1P40202 YLR156C-AYLR156C-A 132 nt2.56□□□□□ -2
CCS1P40202 YLR157C-CYLR157C-C 132 nt2.56□□□□□ -2
CCS1P40202 YLR159C-AYLR159C-A 132 nt2.56□□□□□ -2
CCS1P40202 DCS1YLR270W 1053 nt2.56□□□□□ -2
CCS1P40202 GCD7YLR291C 1146 nt2.56□□□□□ -2
CCS1P40202 CPR8YNR028W 927 nt2.56□□□□□ -2
CCS1P40202 RPL20BYOR312C 519 nt2.56□□□□□ -2
CCS1P40202 TAF3YPL011C 1062 nt2.56□□□□□ -2
CCS1P40202 YBR138CYBR138C 1575 nt2.56□□□□□ -2
CCS1P40202 CCT7YJL111W 1653 nt2.56□□□□□ -2
CCS1P40202 AIM14YGL160W 1713 nt2.56□□□□□ -2
CCS1P40202 NDT80YHR124W 1884 nt2.56□□□□□ -2
CCS1P40202 LCB4YOR171C 1875 nt2.56□□□□□ -2
CCS1P40202 STE6YKL209C 3873 nt2.56□□□□□ -2
CCS1P40202 YCR101CYCR101C 549 nt2.55□□□□□ -2
CCS1P40202 YDR442WYDR442W 393 nt2.55□□□□□ -2
CCS1P40202 UTP25YIL091C 2166 nt2.55□□□□□ -2
CCS1P40202 DAL2YIR029W 1032 nt2.55□□□□□ -2
CCS1P40202 SFH1YLR321C 1281 nt2.55□□□□□ -2
CCS1P40202 RUF21RUF21 707 nt2.55□□□□□ -2
CCS1P40202 NCE103YNL036W 666 nt2.55□□□□□ -2
CCS1P40202 VPS27YNR006W 1869 nt2.55□□□□□ -2
CCS1P40202 FLO1YAR050W 4614 nt2.54□□□□□ -2
CCS1P40202 SPB4YFL002C 1821 nt2.54□□□□□ -2
CCS1P40202 PGS1YCL004W 1566 nt2.54□□□□□ -2
CCS1P40202 DYN2YDR424C 279 nt2.54□□□□□ -2
CCS1P40202 ERG26YGL001C 1050 nt2.54□□□□□ -2
CCS1P40202 LIF1YGL090W 1266 nt2.54□□□□□ -2
CCS1P40202 TOS8YGL096W 831 nt2.54□□□□□ -2
CCS1P40202 ARD1YHR013C 717 nt2.54□□□□□ -2
CCS1P40202 RPS21BYJL136C 264 nt2.54□□□□□ -2
CCS1P40202 MAK16YAL025C 921 nt2.54□□□□□ -2
CCS1P40202 PEX12YMR026C 1200 nt2.54□□□□□ -2
CCS1P40202 YBL039W-BYBL039W-B 180 nt2.54□□□□□ -2
CCS1P40202 ARO4YBR249C 1113 nt2.54□□□□□ -2
CCS1P40202 YIL169CYIL169C 2988 nt2.53□□□□□ -2
CCS1P40202 YPL216WYPL216W 3309 nt2.53□□□□□ -2
CCS1P40202 RGC1YPR115W 3252 nt2.53□□□□□ -2
CCS1P40202 ERV14YGL054C 417 nt2.53□□□□□ -2
CCS1P40202 YKL091CYKL091C 933 nt2.53□□□□□ -2
CCS1P40202 RPL6AYML073C 531 nt2.53□□□□□ -2
CCS1P40202 SEC14YMR079W 915 nt2.53□□□□□ -2
CCS1P40202 ERG2YMR202W 669 nt2.53□□□□□ -2
CCS1P40202 YOR073W-AYOR073W-A 234 nt2.53□□□□□ -2
CCS1P40202 YOR186WYOR186W 435 nt2.53□□□□□ -2
CCS1P40202 ROM1YGR070W 3468 nt2.53□□□□□ -2
CCS1P40202 TAO3YIL129C 7131 nt2.53□□□□□ -2
CCS1P40202 SDS23YGL056C 1584 nt2.53□□□□□ -2.01
CCS1P40202 POL31YJR006W 1464 nt2.52□□□□□ -2.01
CCS1P40202 PMR1YGL167C 2853 nt2.52□□□□□ -2.01
CCS1P40202 DYN1YKR054C 12279 nt2.52□□□□□ -2.01
CCS1P40202 OKP1YGR179C 1221 nt2.52□□□□□ -2.01
CCS1P40202 YHR180WYHR180W 492 nt2.52□□□□□ -2.01
CCS1P40202 AHP1YLR109W 531 nt2.52□□□□□ -2.01
CCS1P40202 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt2.52□□□□□ -2.01
CCS1P40202 BUD21YOR078W 645 nt2.52□□□□□ -2.01
CCS1P40202 EMP70YLR083C 2004 nt2.52□□□□□ -2.01
CCS1P40202 HEH2YDR458C 1992 nt2.52□□□□□ -2.01
CCS1P40202 SPO77YLR341W 1434 nt2.51□□□□□ -2.01
CCS1P40202 YKL222CYKL222C 2118 nt2.51□□□□□ -2.01
CCS1P40202 CDH1YGL003C 1701 nt2.51□□□□□ -2.01
CCS1P40202 BCS1YDR375C 1371 nt2.51□□□□□ -2.01
CCS1P40202 BPT1YLL015W 4680 nt2.51□□□□□ -2.01
CCS1P40202 CEX1YOR112W 2286 nt2.51□□□□□ -2.01
CCS1P40202 MIX14YDR031W 366 nt2.51□□□□□ -2.01
CCS1P40202 SNL1YIL016W 480 nt2.51□□□□□ -2.01
CCS1P40202 SSU72YNL222W 621 nt2.51□□□□□ -2.01
CCS1P40202 PSF3YOL146W 585 nt2.51□□□□□ -2.01
CCS1P40202 DIM1YPL266W 957 nt2.51□□□□□ -2.01
CCS1P40202 ANT1YPR128C 987 nt2.51□□□□□ -2.01
CCS1P40202 TOP1YOL006C 2310 nt2.51□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13 ms