Protein–RNA interactions for Protein: P32842

VMA11, V-type proton ATPase subunit c', yeast

Predictions only

Length 164 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VMA11	P32842	ISW2	YOR304W	3363 nt		2.77	□□□□□ -1.97
VMA11	P32842	SSE2	YBR169C	2082 nt		2.77	□□□□□ -1.97
VMA11	P32842	YCR007C	YCR007C	720 nt		2.77	□□□□□ -1.97
VMA11	P32842	NSE3	YDR288W	912 nt		2.77	□□□□□ -1.97
VMA11	P32842	YGL041W-A	YGL041W-A	465 nt		2.77	□□□□□ -1.97
VMA11	P32842	AGE2	YIL044C	897 nt		2.77	□□□□□ -1.97
VMA11	P32842	REG2	YBR050C	1017 nt		2.77	□□□□□ -1.97
VMA11	P32842	TAF14	YPL129W	735 nt		2.77	□□□□□ -1.97
VMA11	P32842	MRPL51	YPR100W	423 nt		2.77	□□□□□ -1.97
VMA11	P32842	YPK3	YBR028C	1578 nt		2.77	□□□□□ -1.97
VMA11	P32842	BMS1	YPL217C	3552 nt		2.77	□□□□□ -1.97
VMA11	P32842	TED1	YIL039W	1422 nt		2.76	□□□□□ -1.97
VMA11	P32842	MSR1	YHR091C	1932 nt		2.76	□□□□□ -1.97
VMA11	P32842	ABD1	YBR236C	1311 nt		2.76	□□□□□ -1.97
VMA11	P32842	tK(UUU)D	tK(UUU)D	73 nt		2.76	□□□□□ -1.97
VMA11	P32842	tK(UUU)G1	tK(UUU)G1	73 nt		2.76	□□□□□ -1.97
VMA11	P32842	tK(UUU)G2	tK(UUU)G2	73 nt		2.76	□□□□□ -1.97
VMA11	P32842	tK(UUU)K	tK(UUU)K	73 nt		2.76	□□□□□ -1.97
VMA11	P32842	tK(UUU)L	tK(UUU)L	73 nt		2.76	□□□□□ -1.97
VMA11	P32842	tK(UUU)O	tK(UUU)O	73 nt		2.76	□□□□□ -1.97
VMA11	P32842	tK(UUU)P	tK(UUU)P	73 nt		2.76	□□□□□ -1.97
VMA11	P32842	YIL089W	YIL089W	618 nt		2.76	□□□□□ -1.97
VMA11	P32842	DLS1	YJL065C	504 nt		2.76	□□□□□ -1.97
VMA11	P32842	REE1	YJL217W	597 nt		2.76	□□□□□ -1.97
VMA11	P32842	TAF4	YMR005W	1167 nt		2.76	□□□□□ -1.97
VMA11	P32842	RPS9B	YBR189W	588 nt		2.76	□□□□□ -1.97
VMA11	P32842	EXO5	YBR163W	1758 nt		2.76	□□□□□ -1.97
VMA11	P32842	YGR117C	YGR117C	1431 nt		2.76	□□□□□ -1.97
VMA11	P32842	UTP25	YIL091C	2166 nt		2.76	□□□□□ -1.97
VMA11	P32842	MSA1	YOR066W	1890 nt		2.75	□□□□□ -1.97
VMA11	P32842	MDN1	YLR106C	14733 nt		2.75	□□□□□ -1.97
VMA11	P32842	ARO1	YDR127W	4767 nt		2.75	□□□□□ -1.97
VMA11	P32842	DUO1	YGL061C	744 nt		2.75	□□□□□ -1.97
VMA11	P32842	CIR1	YGR207C	786 nt		2.75	□□□□□ -1.97
VMA11	P32842	RPS28B	YLR264W	204 nt		2.75	□□□□□ -1.97
VMA11	P32842	SPC24	YMR117C	642 nt		2.75	□□□□□ -1.97
VMA11	P32842	RPC34	YNR003C	954 nt		2.75	□□□□□ -1.97
VMA11	P32842	VPS30	YPL120W	1674 nt		2.75	□□□□□ -1.97
VMA11	P32842	YMR1	YJR110W	2067 nt		2.75	□□□□□ -1.97
VMA11	P32842	ENA2	YDR039C	3276 nt		2.74	□□□□□ -1.97
VMA11	P32842	ENA1	YDR040C	3276 nt		2.74	□□□□□ -1.97
VMA11	P32842	SEC6	YIL068C	2418 nt		2.74	□□□□□ -1.97
VMA11	P32842	YCL076W	YCL076W	744 nt		2.74	□□□□□ -1.97
VMA11	P32842	YEL032C-A	YEL032C-A	162 nt		2.74	□□□□□ -1.97
VMA11	P32842	YOS1	YER074W-A	258 nt		2.74	□□□□□ -1.97
VMA11	P32842	IRC6	YFR043C	714 nt		2.74	□□□□□ -1.97
VMA11	P32842	YGR149W	YGR149W	1299 nt		2.74	□□□□□ -1.97
VMA11	P32842	YHR069C-A	YHR069C-A	363 nt		2.74	□□□□□ -1.97
VMA11	P32842	IRC25	YLR021W	540 nt		2.74	□□□□□ -1.97
VMA11	P32842	CPR8	YNR028W	927 nt		2.74	□□□□□ -1.97
VMA11	P32842	YBR053C	YBR053C	1077 nt		2.74	□□□□□ -1.97
VMA11	P32842	MIC60	YKR016W	1623 nt		2.74	□□□□□ -1.97
VMA11	P32842	YBR238C	YBR238C	2196 nt		2.74	□□□□□ -1.97
VMA11	P32842	CTK1	YKL139W	1587 nt		2.74	□□□□□ -1.97
VMA11	P32842	CPA2	YJR109C	3357 nt		2.74	□□□□□ -1.97
VMA11	P32842	ULP1	YPL020C	1866 nt		2.73	□□□□□ -1.97
VMA11	P32842	FRE4	YNR060W	2160 nt		2.73	□□□□□ -1.97
VMA11	P32842	GRX6	YDL010W	696 nt		2.73	□□□□□ -1.97
VMA11	P32842	MGT1	YDL200C	567 nt		2.73	□□□□□ -1.97
VMA11	P32842	FCF1	YDR339C	570 nt		2.73	□□□□□ -1.97
VMA11	P32842	YNL144W-A	YNL144W-A	84 nt		2.73	□□□□□ -1.97
VMA11	P32842	TCP1	YDR212W	1680 nt		2.73	□□□□□ -1.97
VMA11	P32842	DOA4	YDR069C	2781 nt		2.72	□□□□□ -1.97
VMA11	P32842	TAF1	YGR274C	3201 nt		2.72	□□□□□ -1.97
VMA11	P32842	DAN4	YJR151C	3486 nt		2.72	□□□□□ -1.97
VMA11	P32842	MED2	YDL005C	1296 nt		2.72	□□□□□ -1.97
VMA11	P32842	RPS8B	YER102W	603 nt		2.72	□□□□□ -1.97
VMA11	P32842	YGR204C-A	YGR204C-A	114 nt		2.72	□□□□□ -1.97
VMA11	P32842	YIL025C	YIL025C	375 nt		2.72	□□□□□ -1.97
VMA11	P32842	AHP1	YLR109W	531 nt		2.72	□□□□□ -1.97
VMA11	P32842	PRM15	YMR278W	1869 nt		2.72	□□□□□ -1.97
VMA11	P32842	RPS8A	YBL072C	603 nt		2.72	□□□□□ -1.97
VMA11	P32842	NDJ1	YOL104C	1059 nt		2.72	□□□□□ -1.97
VMA11	P32842	FES1	YBR101C	873 nt		2.72	□□□□□ -1.97
VMA11	P32842	RPA135	YPR010C	3612 nt		2.72	□□□□□ -1.97
VMA11	P32842	SLM2	YNL047C	1971 nt		2.72	□□□□□ -1.97
VMA11	P32842	MGR3	YMR115W	1506 nt		2.72	□□□□□ -1.97
VMA11	P32842	YDL180W	YDL180W	1644 nt		2.71	□□□□□ -1.97
VMA11	P32842	TRS120	YDR407C	3870 nt		2.71	□□□□□ -1.97
VMA11	P32842	DSN1	YIR010W	1731 nt		2.71	□□□□□ -1.98
VMA11	P32842	STE6	YKL209C	3873 nt		2.71	□□□□□ -1.98
VMA11	P32842	MRPL11	YDL202W	750 nt		2.71	□□□□□ -1.98
VMA11	P32842	RAD10	YML095C	633 nt		2.71	□□□□□ -1.98
VMA11	P32842	YBL094C	YBL094C	333 nt		2.71	□□□□□ -1.98
VMA11	P32842	VAM10	YOR068C	345 nt		2.71	□□□□□ -1.98
VMA11	P32842	HDA2	YDR295C	2025 nt		2.71	□□□□□ -1.98
VMA11	P32842	YVC1	YOR087W	2028 nt		2.71	□□□□□ -1.98
VMA11	P32842	ASI1	YMR119W	1875 nt		2.71	□□□□□ -1.98
VMA11	P32842	RTT109	YLL002W	1311 nt		2.7	□□□□□ -1.98
VMA11	P32842	snR63	snR63	255 nt		2.7	□□□□□ -1.98
VMA11	P32842	EDC1	YGL222C	528 nt		2.7	□□□□□ -1.98
VMA11	P32842	tV(CAC)D	tV(CAC)D	73 nt		2.7	□□□□□ -1.98
VMA11	P32842	tV(CAC)H	tV(CAC)H	73 nt		2.7	□□□□□ -1.98
VMA11	P32842	LSM1	YJL124C	519 nt		2.7	□□□□□ -1.98
VMA11	P32842	MSA2	YKR077W	1092 nt		2.7	□□□□□ -1.98
VMA11	P32842	YBL065W	YBL065W	345 nt		2.7	□□□□□ -1.98
VMA11	P32842	INN1	YNL152W	1230 nt		2.7	□□□□□ -1.98
VMA11	P32842	RPA43	YOR340C	981 nt		2.7	□□□□□ -1.98
VMA11	P32842	YPR077C	YPR077C	372 nt		2.7	□□□□□ -1.98
VMA11	P32842	DAP2	YHR028C	2457 nt		2.7	□□□□□ -1.98

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 17.9 ms