Protein–RNA interactions for Protein: P32780

GTF2H1, General transcription factor IIH subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H1P32780 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2H1P32780 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2H1P32780 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2H1P32780 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2H1P32780 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2H1P32780 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2H1P32780 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2H1P32780 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2H1P32780 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2H1P32780 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2H1P32780 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2H1P32780 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2H1P32780 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2H1P32780 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2H1P32780 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2H1P32780 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2H1P32780 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2H1P32780 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2H1P32780 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2H1P32780 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2H1P32780 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2H1P32780 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2H1P32780 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2H1P32780 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2H1P32780 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2H1P32780 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2H1P32780 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2H1P32780 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2H1P32780 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2H1P32780 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2H1P32780 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2H1P32780 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2H1P32780 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2H1P32780 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2H1P32780 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2H1P32780 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2H1P32780 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2H1P32780 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2H1P32780 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2H1P32780 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2H1P32780 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2H1P32780 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2H1P32780 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2H1P32780 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2H1P32780 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2H1P32780 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2H1P32780 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2H1P32780 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2H1P32780 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2H1P32780 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2H1P32780 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2H1P32780 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2H1P32780 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2H1P32780 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2H1P32780 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2H1P32780 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2H1P32780 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2H1P32780 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2H1P32780 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2H1P32780 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2H1P32780 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2H1P32780 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2H1P32780 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2H1P32780 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2H1P32780 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2H1P32780 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2H1P32780 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2H1P32780 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2H1P32780 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2H1P32780 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2H1P32780 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2H1P32780 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2H1P32780 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2H1P32780 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2H1P32780 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2H1P32780 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2H1P32780 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2H1P32780 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2H1P32780 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2H1P32780 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2H1P32780 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2H1P32780 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2H1P32780 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2H1P32780 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2H1P32780 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2H1P32780 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2H1P32780 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2H1P32780 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2H1P32780 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2H1P32780 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2H1P32780 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2H1P32780 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2H1P32780 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2H1P32780 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2H1P32780 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2H1P32780 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2H1P32780 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2H1P32780 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2H1P32780 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2H1P32780 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms