Protein–RNA interactions for Protein: P27641

Xrcc5, X-ray repair cross-complementing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc5P27641 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Xrcc5P27641 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Xrcc5P27641 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Xrcc5P27641 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Xrcc5P27641 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Xrcc5P27641 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Xrcc5P27641 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Xrcc5P27641 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Xrcc5P27641 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Xrcc5P27641 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Xrcc5P27641 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Xrcc5P27641 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Xrcc5P27641 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Xrcc5P27641 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Xrcc5P27641 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Xrcc5P27641 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Xrcc5P27641 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Xrcc5P27641 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Xrcc5P27641 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Xrcc5P27641 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Xrcc5P27641 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Xrcc5P27641 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Xrcc5P27641 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Xrcc5P27641 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Xrcc5P27641 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Xrcc5P27641 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Xrcc5P27641 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Xrcc5P27641 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Xrcc5P27641 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Xrcc5P27641 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Xrcc5P27641 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Xrcc5P27641 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Xrcc5P27641 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Xrcc5P27641 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Xrcc5P27641 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Xrcc5P27641 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Xrcc5P27641 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Xrcc5P27641 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Xrcc5P27641 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Xrcc5P27641 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Xrcc5P27641 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Xrcc5P27641 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Xrcc5P27641 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Xrcc5P27641 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Xrcc5P27641 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Xrcc5P27641 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Xrcc5P27641 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Xrcc5P27641 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Xrcc5P27641 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Xrcc5P27641 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Xrcc5P27641 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Xrcc5P27641 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Xrcc5P27641 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Xrcc5P27641 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Xrcc5P27641 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Xrcc5P27641 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Xrcc5P27641 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Xrcc5P27641 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Xrcc5P27641 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Xrcc5P27641 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Xrcc5P27641 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Xrcc5P27641 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Xrcc5P27641 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Xrcc5P27641 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Xrcc5P27641 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Xrcc5P27641 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Xrcc5P27641 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Xrcc5P27641 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Xrcc5P27641 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Xrcc5P27641 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Xrcc5P27641 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Xrcc5P27641 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Xrcc5P27641 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Xrcc5P27641 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Xrcc5P27641 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Xrcc5P27641 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Xrcc5P27641 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Xrcc5P27641 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Xrcc5P27641 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Xrcc5P27641 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Xrcc5P27641 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Xrcc5P27641 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Xrcc5P27641 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Xrcc5P27641 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Xrcc5P27641 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Xrcc5P27641 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Xrcc5P27641 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Xrcc5P27641 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Xrcc5P27641 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Xrcc5P27641 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Xrcc5P27641 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Xrcc5P27641 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Xrcc5P27641 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Xrcc5P27641 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Xrcc5P27641 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Xrcc5P27641 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Xrcc5P27641 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Xrcc5P27641 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Xrcc5P27641 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Xrcc5P27641 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
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