Protein–RNA interactions for Protein: P23708

Nfya, Nuclear transcription factor Y subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfyaP23708 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NfyaP23708 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NfyaP23708 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfyaP23708 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfyaP23708 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfyaP23708 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfyaP23708 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfyaP23708 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfyaP23708 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfyaP23708 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfyaP23708 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NfyaP23708 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NfyaP23708 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfyaP23708 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfyaP23708 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfyaP23708 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfyaP23708 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfyaP23708 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NfyaP23708 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NfyaP23708 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NfyaP23708 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NfyaP23708 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NfyaP23708 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NfyaP23708 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NfyaP23708 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NfyaP23708 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NfyaP23708 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NfyaP23708 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NfyaP23708 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NfyaP23708 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NfyaP23708 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NfyaP23708 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NfyaP23708 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NfyaP23708 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NfyaP23708 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NfyaP23708 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NfyaP23708 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfyaP23708 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfyaP23708 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfyaP23708 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfyaP23708 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfyaP23708 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfyaP23708 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfyaP23708 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfyaP23708 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfyaP23708 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfyaP23708 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfyaP23708 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfyaP23708 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NfyaP23708 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NfyaP23708 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NfyaP23708 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NfyaP23708 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NfyaP23708 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NfyaP23708 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NfyaP23708 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NfyaP23708 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NfyaP23708 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NfyaP23708 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NfyaP23708 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfyaP23708 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfyaP23708 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfyaP23708 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfyaP23708 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfyaP23708 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfyaP23708 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfyaP23708 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfyaP23708 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfyaP23708 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NfyaP23708 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfyaP23708 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfyaP23708 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfyaP23708 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfyaP23708 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfyaP23708 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfyaP23708 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NfyaP23708 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfyaP23708 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfyaP23708 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfyaP23708 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfyaP23708 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfyaP23708 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfyaP23708 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NfyaP23708 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfyaP23708 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfyaP23708 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfyaP23708 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfyaP23708 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NfyaP23708 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NfyaP23708 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NfyaP23708 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NfyaP23708 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NfyaP23708 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NfyaP23708 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NfyaP23708 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NfyaP23708 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NfyaP23708 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NfyaP23708 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NfyaP23708 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NfyaP23708 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms