Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FGFR3P22607 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FGFR3P22607 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FGFR3P22607 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FGFR3P22607 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FGFR3P22607 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FGFR3P22607 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FGFR3P22607 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FGFR3P22607 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FGFR3P22607 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FGFR3P22607 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FGFR3P22607 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FGFR3P22607 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
FGFR3P22607 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FGFR3P22607 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FGFR3P22607 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
FGFR3P22607 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FGFR3P22607 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FGFR3P22607 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FGFR3P22607 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FGFR3P22607 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
FGFR3P22607 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
FGFR3P22607 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FGFR3P22607 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
FGFR3P22607 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
FGFR3P22607 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FGFR3P22607 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FGFR3P22607 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
FGFR3P22607 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FGFR3P22607 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FGFR3P22607 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FGFR3P22607 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FGFR3P22607 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FGFR3P22607 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
FGFR3P22607 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FGFR3P22607 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FGFR3P22607 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FGFR3P22607 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FGFR3P22607 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FGFR3P22607 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FGFR3P22607 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FGFR3P22607 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FGFR3P22607 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FGFR3P22607 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FGFR3P22607 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FGFR3P22607 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FGFR3P22607 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FGFR3P22607 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FGFR3P22607 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FGFR3P22607 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FGFR3P22607 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FGFR3P22607 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FGFR3P22607 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FGFR3P22607 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FGFR3P22607 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FGFR3P22607 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FGFR3P22607 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FGFR3P22607 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FGFR3P22607 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FGFR3P22607 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FGFR3P22607 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FGFR3P22607 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FGFR3P22607 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FGFR3P22607 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FGFR3P22607 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
FGFR3P22607 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FGFR3P22607 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FGFR3P22607 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FGFR3P22607 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FGFR3P22607 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FGFR3P22607 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FGFR3P22607 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FGFR3P22607 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FGFR3P22607 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FGFR3P22607 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
FGFR3P22607 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FGFR3P22607 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FGFR3P22607 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FGFR3P22607 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FGFR3P22607 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FGFR3P22607 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FGFR3P22607 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FGFR3P22607 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FGFR3P22607 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FGFR3P22607 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FGFR3P22607 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FGFR3P22607 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
FGFR3P22607 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FGFR3P22607 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
FGFR3P22607 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FGFR3P22607 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FGFR3P22607 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FGFR3P22607 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FGFR3P22607 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FGFR3P22607 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FGFR3P22607 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FGFR3P22607 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
FGFR3P22607 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
FGFR3P22607 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FGFR3P22607 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms