Protein–RNA interactions for Protein: P20036

HLA-DPA1, HLA class II histocompatibility antigen, DP alpha 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DPA1P20036 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HLA-DPA1P20036 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HLA-DPA1P20036 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HLA-DPA1P20036 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HLA-DPA1P20036 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HLA-DPA1P20036 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HLA-DPA1P20036 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HLA-DPA1P20036 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HLA-DPA1P20036 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HLA-DPA1P20036 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HLA-DPA1P20036 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HLA-DPA1P20036 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HLA-DPA1P20036 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HLA-DPA1P20036 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HLA-DPA1P20036 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HLA-DPA1P20036 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HLA-DPA1P20036 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HLA-DPA1P20036 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HLA-DPA1P20036 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HLA-DPA1P20036 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HLA-DPA1P20036 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HLA-DPA1P20036 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HLA-DPA1P20036 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HLA-DPA1P20036 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HLA-DPA1P20036 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HLA-DPA1P20036 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HLA-DPA1P20036 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HLA-DPA1P20036 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HLA-DPA1P20036 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HLA-DPA1P20036 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HLA-DPA1P20036 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HLA-DPA1P20036 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HLA-DPA1P20036 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HLA-DPA1P20036 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HLA-DPA1P20036 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HLA-DPA1P20036 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HLA-DPA1P20036 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HLA-DPA1P20036 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HLA-DPA1P20036 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HLA-DPA1P20036 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HLA-DPA1P20036 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HLA-DPA1P20036 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HLA-DPA1P20036 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HLA-DPA1P20036 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HLA-DPA1P20036 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HLA-DPA1P20036 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HLA-DPA1P20036 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HLA-DPA1P20036 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HLA-DPA1P20036 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HLA-DPA1P20036 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HLA-DPA1P20036 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HLA-DPA1P20036 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HLA-DPA1P20036 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HLA-DPA1P20036 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HLA-DPA1P20036 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HLA-DPA1P20036 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HLA-DPA1P20036 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HLA-DPA1P20036 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HLA-DPA1P20036 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HLA-DPA1P20036 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HLA-DPA1P20036 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HLA-DPA1P20036 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HLA-DPA1P20036 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HLA-DPA1P20036 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HLA-DPA1P20036 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HLA-DPA1P20036 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HLA-DPA1P20036 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HLA-DPA1P20036 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
HLA-DPA1P20036 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HLA-DPA1P20036 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HLA-DPA1P20036 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HLA-DPA1P20036 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HLA-DPA1P20036 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HLA-DPA1P20036 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HLA-DPA1P20036 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HLA-DPA1P20036 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HLA-DPA1P20036 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HLA-DPA1P20036 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HLA-DPA1P20036 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HLA-DPA1P20036 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HLA-DPA1P20036 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HLA-DPA1P20036 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HLA-DPA1P20036 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HLA-DPA1P20036 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HLA-DPA1P20036 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HLA-DPA1P20036 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HLA-DPA1P20036 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HLA-DPA1P20036 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HLA-DPA1P20036 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HLA-DPA1P20036 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HLA-DPA1P20036 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HLA-DPA1P20036 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HLA-DPA1P20036 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HLA-DPA1P20036 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HLA-DPA1P20036 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HLA-DPA1P20036 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HLA-DPA1P20036 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HLA-DPA1P20036 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HLA-DPA1P20036 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HLA-DPA1P20036 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms