Protein–RNA interactions for Protein: P15923

TCF3, Transcription factor E2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF3P15923 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCF3P15923 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCF3P15923 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCF3P15923 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCF3P15923 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCF3P15923 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCF3P15923 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCF3P15923 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TCF3P15923 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCF3P15923 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCF3P15923 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCF3P15923 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCF3P15923 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCF3P15923 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCF3P15923 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCF3P15923 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCF3P15923 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCF3P15923 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCF3P15923 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TCF3P15923 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TCF3P15923 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCF3P15923 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCF3P15923 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCF3P15923 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCF3P15923 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCF3P15923 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCF3P15923 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCF3P15923 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCF3P15923 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCF3P15923 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCF3P15923 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCF3P15923 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCF3P15923 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCF3P15923 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCF3P15923 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCF3P15923 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCF3P15923 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCF3P15923 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCF3P15923 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TCF3P15923 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCF3P15923 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCF3P15923 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCF3P15923 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCF3P15923 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCF3P15923 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCF3P15923 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCF3P15923 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCF3P15923 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCF3P15923 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCF3P15923 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCF3P15923 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TCF3P15923 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCF3P15923 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCF3P15923 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCF3P15923 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCF3P15923 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCF3P15923 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCF3P15923 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCF3P15923 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCF3P15923 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCF3P15923 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TCF3P15923 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCF3P15923 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCF3P15923 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCF3P15923 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCF3P15923 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCF3P15923 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCF3P15923 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCF3P15923 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCF3P15923 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCF3P15923 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCF3P15923 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TCF3P15923 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCF3P15923 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCF3P15923 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCF3P15923 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCF3P15923 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCF3P15923 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCF3P15923 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCF3P15923 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCF3P15923 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCF3P15923 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCF3P15923 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCF3P15923 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCF3P15923 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCF3P15923 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCF3P15923 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCF3P15923 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCF3P15923 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCF3P15923 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCF3P15923 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCF3P15923 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCF3P15923 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCF3P15923 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TCF3P15923 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCF3P15923 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TCF3P15923 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCF3P15923 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCF3P15923 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCF3P15923 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms