Protein–RNA interactions for Protein: P11440

Cdk1, Cyclin-dependent kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk1P11440 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdk1P11440 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdk1P11440 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdk1P11440 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdk1P11440 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdk1P11440 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdk1P11440 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdk1P11440 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdk1P11440 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdk1P11440 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdk1P11440 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdk1P11440 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdk1P11440 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdk1P11440 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdk1P11440 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdk1P11440 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdk1P11440 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdk1P11440 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdk1P11440 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdk1P11440 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdk1P11440 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdk1P11440 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdk1P11440 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdk1P11440 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdk1P11440 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdk1P11440 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdk1P11440 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdk1P11440 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdk1P11440 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdk1P11440 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdk1P11440 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cdk1P11440 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cdk1P11440 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cdk1P11440 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cdk1P11440 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cdk1P11440 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdk1P11440 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdk1P11440 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdk1P11440 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdk1P11440 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdk1P11440 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdk1P11440 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdk1P11440 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdk1P11440 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdk1P11440 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdk1P11440 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdk1P11440 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdk1P11440 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdk1P11440 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdk1P11440 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdk1P11440 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cdk1P11440 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdk1P11440 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdk1P11440 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdk1P11440 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdk1P11440 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdk1P11440 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdk1P11440 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdk1P11440 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdk1P11440 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdk1P11440 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdk1P11440 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdk1P11440 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdk1P11440 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdk1P11440 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdk1P11440 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdk1P11440 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdk1P11440 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdk1P11440 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdk1P11440 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdk1P11440 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdk1P11440 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdk1P11440 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdk1P11440 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdk1P11440 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdk1P11440 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdk1P11440 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdk1P11440 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdk1P11440 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdk1P11440 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdk1P11440 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdk1P11440 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdk1P11440 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdk1P11440 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdk1P11440 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdk1P11440 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdk1P11440 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdk1P11440 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdk1P11440 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdk1P11440 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdk1P11440 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdk1P11440 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdk1P11440 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdk1P11440 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdk1P11440 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdk1P11440 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdk1P11440 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdk1P11440 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdk1P11440 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdk1P11440 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms