Protein–RNA interactions for Protein: P10720

PF4V1, Platelet factor 4 variant, humanhuman

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PF4V1P10720 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PF4V1P10720 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PF4V1P10720 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PF4V1P10720 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PF4V1P10720 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PF4V1P10720 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PF4V1P10720 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PF4V1P10720 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PF4V1P10720 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PF4V1P10720 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PF4V1P10720 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PF4V1P10720 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PF4V1P10720 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PF4V1P10720 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PF4V1P10720 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PF4V1P10720 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PF4V1P10720 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PF4V1P10720 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PF4V1P10720 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PF4V1P10720 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PF4V1P10720 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PF4V1P10720 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PF4V1P10720 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PF4V1P10720 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PF4V1P10720 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PF4V1P10720 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PF4V1P10720 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PF4V1P10720 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PF4V1P10720 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PF4V1P10720 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PF4V1P10720 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PF4V1P10720 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PF4V1P10720 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PF4V1P10720 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PF4V1P10720 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PF4V1P10720 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PF4V1P10720 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PF4V1P10720 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PF4V1P10720 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PF4V1P10720 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PF4V1P10720 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PF4V1P10720 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PF4V1P10720 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PF4V1P10720 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PF4V1P10720 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PF4V1P10720 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PF4V1P10720 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PF4V1P10720 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PF4V1P10720 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PF4V1P10720 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PF4V1P10720 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PF4V1P10720 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PF4V1P10720 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PF4V1P10720 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PF4V1P10720 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PF4V1P10720 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PF4V1P10720 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PF4V1P10720 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PF4V1P10720 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PF4V1P10720 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PF4V1P10720 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PF4V1P10720 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PF4V1P10720 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PF4V1P10720 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PF4V1P10720 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PF4V1P10720 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PF4V1P10720 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PF4V1P10720 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PF4V1P10720 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PF4V1P10720 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PF4V1P10720 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PF4V1P10720 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PF4V1P10720 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PF4V1P10720 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PF4V1P10720 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PF4V1P10720 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PF4V1P10720 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PF4V1P10720 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PF4V1P10720 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PF4V1P10720 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PF4V1P10720 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PF4V1P10720 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PF4V1P10720 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PF4V1P10720 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PF4V1P10720 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PF4V1P10720 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PF4V1P10720 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PF4V1P10720 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PF4V1P10720 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PF4V1P10720 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PF4V1P10720 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PF4V1P10720 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PF4V1P10720 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PF4V1P10720 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PF4V1P10720 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PF4V1P10720 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PF4V1P10720 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PF4V1P10720 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PF4V1P10720 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PF4V1P10720 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms