Protein–RNA interactions for Protein: P0CI26

TRIM49C, Tripartite motif-containing protein 49C, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM49CP0CI26 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM49CP0CI26 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM49CP0CI26 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM49CP0CI26 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM49CP0CI26 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM49CP0CI26 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM49CP0CI26 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM49CP0CI26 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM49CP0CI26 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM49CP0CI26 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM49CP0CI26 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM49CP0CI26 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM49CP0CI26 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM49CP0CI26 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM49CP0CI26 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM49CP0CI26 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM49CP0CI26 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM49CP0CI26 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM49CP0CI26 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM49CP0CI26 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM49CP0CI26 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM49CP0CI26 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM49CP0CI26 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM49CP0CI26 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM49CP0CI26 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM49CP0CI26 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM49CP0CI26 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM49CP0CI26 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM49CP0CI26 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM49CP0CI26 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM49CP0CI26 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM49CP0CI26 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM49CP0CI26 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM49CP0CI26 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM49CP0CI26 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM49CP0CI26 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM49CP0CI26 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM49CP0CI26 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM49CP0CI26 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM49CP0CI26 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM49CP0CI26 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM49CP0CI26 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM49CP0CI26 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM49CP0CI26 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM49CP0CI26 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM49CP0CI26 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM49CP0CI26 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM49CP0CI26 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM49CP0CI26 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM49CP0CI26 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM49CP0CI26 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM49CP0CI26 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM49CP0CI26 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM49CP0CI26 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM49CP0CI26 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM49CP0CI26 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM49CP0CI26 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM49CP0CI26 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM49CP0CI26 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM49CP0CI26 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM49CP0CI26 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM49CP0CI26 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM49CP0CI26 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM49CP0CI26 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM49CP0CI26 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM49CP0CI26 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM49CP0CI26 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM49CP0CI26 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM49CP0CI26 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM49CP0CI26 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM49CP0CI26 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM49CP0CI26 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM49CP0CI26 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM49CP0CI26 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM49CP0CI26 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM49CP0CI26 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM49CP0CI26 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM49CP0CI26 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM49CP0CI26 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM49CP0CI26 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM49CP0CI26 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM49CP0CI26 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM49CP0CI26 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM49CP0CI26 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM49CP0CI26 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM49CP0CI26 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM49CP0CI26 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM49CP0CI26 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM49CP0CI26 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM49CP0CI26 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM49CP0CI26 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM49CP0CI26 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM49CP0CI26 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM49CP0CI26 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM49CP0CI26 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM49CP0CI26 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM49CP0CI26 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM49CP0CI26 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM49CP0CI26 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM49CP0CI26 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms