Protein–RNA interactions for Protein: P05026

ATP1B1, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B1P05026 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP1B1P05026 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP1B1P05026 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP1B1P05026 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP1B1P05026 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP1B1P05026 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP1B1P05026 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP1B1P05026 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP1B1P05026 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP1B1P05026 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP1B1P05026 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP1B1P05026 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP1B1P05026 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP1B1P05026 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP1B1P05026 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP1B1P05026 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP1B1P05026 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP1B1P05026 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP1B1P05026 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP1B1P05026 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP1B1P05026 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP1B1P05026 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP1B1P05026 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP1B1P05026 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP1B1P05026 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP1B1P05026 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP1B1P05026 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP1B1P05026 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP1B1P05026 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP1B1P05026 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP1B1P05026 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP1B1P05026 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP1B1P05026 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP1B1P05026 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP1B1P05026 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP1B1P05026 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP1B1P05026 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP1B1P05026 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP1B1P05026 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP1B1P05026 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP1B1P05026 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP1B1P05026 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP1B1P05026 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP1B1P05026 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP1B1P05026 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP1B1P05026 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP1B1P05026 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ATP1B1P05026 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ATP1B1P05026 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP1B1P05026 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP1B1P05026 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP1B1P05026 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP1B1P05026 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP1B1P05026 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP1B1P05026 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP1B1P05026 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP1B1P05026 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP1B1P05026 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP1B1P05026 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP1B1P05026 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP1B1P05026 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP1B1P05026 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP1B1P05026 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP1B1P05026 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP1B1P05026 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP1B1P05026 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP1B1P05026 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP1B1P05026 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP1B1P05026 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP1B1P05026 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP1B1P05026 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP1B1P05026 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP1B1P05026 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP1B1P05026 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP1B1P05026 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP1B1P05026 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP1B1P05026 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP1B1P05026 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP1B1P05026 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP1B1P05026 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP1B1P05026 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP1B1P05026 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP1B1P05026 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP1B1P05026 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP1B1P05026 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP1B1P05026 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP1B1P05026 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP1B1P05026 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP1B1P05026 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP1B1P05026 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP1B1P05026 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP1B1P05026 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP1B1P05026 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP1B1P05026 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP1B1P05026 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP1B1P05026 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP1B1P05026 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP1B1P05026 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP1B1P05026 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP1B1P05026 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms