Protein–RNA interactions for Protein: P02458

COL2A1, Collagen alpha-1(II) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL2A1P02458 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
COL2A1P02458 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COL2A1P02458 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
COL2A1P02458 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
COL2A1P02458 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
COL2A1P02458 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COL2A1P02458 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COL2A1P02458 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COL2A1P02458 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL2A1P02458 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL2A1P02458 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL2A1P02458 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
COL2A1P02458 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
COL2A1P02458 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL2A1P02458 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL2A1P02458 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL2A1P02458 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL2A1P02458 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL2A1P02458 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL2A1P02458 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL2A1P02458 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL2A1P02458 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
COL2A1P02458 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL2A1P02458 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL2A1P02458 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL2A1P02458 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL2A1P02458 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL2A1P02458 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL2A1P02458 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL2A1P02458 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
COL2A1P02458 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL2A1P02458 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL2A1P02458 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL2A1P02458 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
COL2A1P02458 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
COL2A1P02458 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL2A1P02458 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL2A1P02458 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL2A1P02458 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
COL2A1P02458 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
COL2A1P02458 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL2A1P02458 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL2A1P02458 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL2A1P02458 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
COL2A1P02458 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
COL2A1P02458 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
COL2A1P02458 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
COL2A1P02458 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
COL2A1P02458 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
COL2A1P02458 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
COL2A1P02458 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
COL2A1P02458 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
COL2A1P02458 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
COL2A1P02458 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COL2A1P02458 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COL2A1P02458 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COL2A1P02458 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
COL2A1P02458 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COL2A1P02458 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
COL2A1P02458 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
COL2A1P02458 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
COL2A1P02458 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
COL2A1P02458 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
COL2A1P02458 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
COL2A1P02458 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COL2A1P02458 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COL2A1P02458 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COL2A1P02458 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
COL2A1P02458 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COL2A1P02458 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COL2A1P02458 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
COL2A1P02458 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
COL2A1P02458 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
COL2A1P02458 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
COL2A1P02458 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
COL2A1P02458 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COL2A1P02458 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COL2A1P02458 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
COL2A1P02458 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
COL2A1P02458 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COL2A1P02458 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COL2A1P02458 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
COL2A1P02458 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COL2A1P02458 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
COL2A1P02458 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
COL2A1P02458 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
COL2A1P02458 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
COL2A1P02458 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
COL2A1P02458 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COL2A1P02458 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COL2A1P02458 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COL2A1P02458 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COL2A1P02458 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
COL2A1P02458 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
COL2A1P02458 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
COL2A1P02458 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
COL2A1P02458 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
COL2A1P02458 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
COL2A1P02458 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
COL2A1P02458 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms