Protein–RNA interactions for Protein: O60423

ATP8B3, Phospholipid-transporting ATPase IK, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8B3O60423 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP8B3O60423 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP8B3O60423 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP8B3O60423 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP8B3O60423 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP8B3O60423 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP8B3O60423 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP8B3O60423 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP8B3O60423 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP8B3O60423 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP8B3O60423 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP8B3O60423 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP8B3O60423 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP8B3O60423 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP8B3O60423 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP8B3O60423 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP8B3O60423 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP8B3O60423 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP8B3O60423 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP8B3O60423 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP8B3O60423 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP8B3O60423 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP8B3O60423 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP8B3O60423 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP8B3O60423 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP8B3O60423 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP8B3O60423 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP8B3O60423 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP8B3O60423 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP8B3O60423 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP8B3O60423 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP8B3O60423 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP8B3O60423 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP8B3O60423 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP8B3O60423 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP8B3O60423 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP8B3O60423 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP8B3O60423 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP8B3O60423 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
ATP8B3O60423 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
ATP8B3O60423 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP8B3O60423 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP8B3O60423 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP8B3O60423 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP8B3O60423 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP8B3O60423 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP8B3O60423 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP8B3O60423 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP8B3O60423 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP8B3O60423 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP8B3O60423 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP8B3O60423 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP8B3O60423 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP8B3O60423 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP8B3O60423 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP8B3O60423 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP8B3O60423 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP8B3O60423 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP8B3O60423 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP8B3O60423 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP8B3O60423 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP8B3O60423 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP8B3O60423 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP8B3O60423 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP8B3O60423 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP8B3O60423 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP8B3O60423 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP8B3O60423 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP8B3O60423 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP8B3O60423 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP8B3O60423 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP8B3O60423 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP8B3O60423 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP8B3O60423 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP8B3O60423 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP8B3O60423 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP8B3O60423 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP8B3O60423 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP8B3O60423 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP8B3O60423 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP8B3O60423 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP8B3O60423 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP8B3O60423 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP8B3O60423 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP8B3O60423 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP8B3O60423 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP8B3O60423 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP8B3O60423 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP8B3O60423 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP8B3O60423 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP8B3O60423 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP8B3O60423 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP8B3O60423 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP8B3O60423 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP8B3O60423 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP8B3O60423 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP8B3O60423 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP8B3O60423 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP8B3O60423 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP8B3O60423 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms