Protein–RNA interactions for Protein: O55125

Nipsnap1, Protein NipSnap homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap1O55125 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nipsnap1O55125 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nipsnap1O55125 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nipsnap1O55125 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nipsnap1O55125 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nipsnap1O55125 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Nipsnap1O55125 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nipsnap1O55125 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nipsnap1O55125 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nipsnap1O55125 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nipsnap1O55125 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nipsnap1O55125 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nipsnap1O55125 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nipsnap1O55125 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nipsnap1O55125 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nipsnap1O55125 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nipsnap1O55125 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nipsnap1O55125 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nipsnap1O55125 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nipsnap1O55125 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nipsnap1O55125 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nipsnap1O55125 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nipsnap1O55125 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nipsnap1O55125 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nipsnap1O55125 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nipsnap1O55125 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nipsnap1O55125 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nipsnap1O55125 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nipsnap1O55125 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nipsnap1O55125 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nipsnap1O55125 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nipsnap1O55125 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nipsnap1O55125 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nipsnap1O55125 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nipsnap1O55125 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nipsnap1O55125 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nipsnap1O55125 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nipsnap1O55125 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nipsnap1O55125 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nipsnap1O55125 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nipsnap1O55125 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nipsnap1O55125 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nipsnap1O55125 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nipsnap1O55125 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nipsnap1O55125 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nipsnap1O55125 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nipsnap1O55125 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nipsnap1O55125 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nipsnap1O55125 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nipsnap1O55125 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nipsnap1O55125 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nipsnap1O55125 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nipsnap1O55125 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nipsnap1O55125 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nipsnap1O55125 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nipsnap1O55125 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nipsnap1O55125 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nipsnap1O55125 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nipsnap1O55125 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nipsnap1O55125 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nipsnap1O55125 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nipsnap1O55125 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nipsnap1O55125 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nipsnap1O55125 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nipsnap1O55125 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nipsnap1O55125 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nipsnap1O55125 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nipsnap1O55125 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nipsnap1O55125 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nipsnap1O55125 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nipsnap1O55125 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nipsnap1O55125 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nipsnap1O55125 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nipsnap1O55125 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nipsnap1O55125 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nipsnap1O55125 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nipsnap1O55125 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nipsnap1O55125 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nipsnap1O55125 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nipsnap1O55125 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nipsnap1O55125 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nipsnap1O55125 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nipsnap1O55125 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nipsnap1O55125 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nipsnap1O55125 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nipsnap1O55125 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nipsnap1O55125 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nipsnap1O55125 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nipsnap1O55125 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nipsnap1O55125 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nipsnap1O55125 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nipsnap1O55125 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nipsnap1O55125 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nipsnap1O55125 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nipsnap1O55125 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nipsnap1O55125 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nipsnap1O55125 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nipsnap1O55125 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nipsnap1O55125 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nipsnap1O55125 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms