Protein–RNA interactions for Protein: O55101

Syngr2, Synaptogyrin-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr2O55101 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syngr2O55101 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syngr2O55101 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syngr2O55101 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syngr2O55101 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syngr2O55101 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syngr2O55101 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syngr2O55101 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syngr2O55101 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syngr2O55101 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syngr2O55101 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syngr2O55101 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syngr2O55101 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syngr2O55101 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syngr2O55101 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syngr2O55101 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syngr2O55101 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syngr2O55101 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syngr2O55101 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syngr2O55101 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syngr2O55101 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syngr2O55101 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syngr2O55101 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syngr2O55101 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syngr2O55101 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syngr2O55101 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syngr2O55101 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syngr2O55101 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syngr2O55101 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syngr2O55101 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syngr2O55101 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Syngr2O55101 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syngr2O55101 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syngr2O55101 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syngr2O55101 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syngr2O55101 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syngr2O55101 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syngr2O55101 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syngr2O55101 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syngr2O55101 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syngr2O55101 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syngr2O55101 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syngr2O55101 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syngr2O55101 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syngr2O55101 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syngr2O55101 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syngr2O55101 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syngr2O55101 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syngr2O55101 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syngr2O55101 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syngr2O55101 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syngr2O55101 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syngr2O55101 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syngr2O55101 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syngr2O55101 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Syngr2O55101 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syngr2O55101 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syngr2O55101 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syngr2O55101 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syngr2O55101 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syngr2O55101 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syngr2O55101 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syngr2O55101 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syngr2O55101 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syngr2O55101 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syngr2O55101 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Syngr2O55101 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syngr2O55101 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syngr2O55101 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syngr2O55101 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Syngr2O55101 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syngr2O55101 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syngr2O55101 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Syngr2O55101 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syngr2O55101 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms