Protein–RNA interactions for Protein: O54926

Siva1, Apoptosis regulatory protein Siva, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siva1O54926 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Siva1O54926 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Siva1O54926 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Siva1O54926 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Siva1O54926 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Siva1O54926 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Siva1O54926 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Siva1O54926 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Siva1O54926 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Siva1O54926 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Siva1O54926 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Siva1O54926 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Siva1O54926 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Siva1O54926 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Siva1O54926 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Siva1O54926 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Siva1O54926 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Siva1O54926 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Siva1O54926 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Siva1O54926 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Siva1O54926 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Siva1O54926 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Siva1O54926 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Siva1O54926 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Siva1O54926 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Siva1O54926 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Siva1O54926 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Siva1O54926 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Siva1O54926 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Siva1O54926 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Siva1O54926 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Siva1O54926 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Siva1O54926 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Siva1O54926 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Siva1O54926 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Siva1O54926 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Siva1O54926 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Siva1O54926 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Siva1O54926 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Siva1O54926 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Siva1O54926 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Siva1O54926 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Siva1O54926 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Siva1O54926 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Siva1O54926 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Siva1O54926 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Siva1O54926 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Siva1O54926 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Siva1O54926 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Siva1O54926 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Siva1O54926 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Siva1O54926 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Siva1O54926 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Siva1O54926 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Siva1O54926 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Siva1O54926 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Siva1O54926 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Siva1O54926 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Siva1O54926 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Siva1O54926 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Siva1O54926 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Siva1O54926 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Siva1O54926 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Siva1O54926 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Siva1O54926 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Siva1O54926 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Siva1O54926 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Siva1O54926 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Siva1O54926 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Siva1O54926 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Siva1O54926 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Siva1O54926 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Siva1O54926 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Siva1O54926 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Siva1O54926 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Siva1O54926 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Siva1O54926 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Siva1O54926 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Siva1O54926 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Siva1O54926 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Siva1O54926 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Siva1O54926 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Siva1O54926 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Siva1O54926 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Siva1O54926 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Siva1O54926 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Siva1O54926 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Siva1O54926 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Siva1O54926 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Siva1O54926 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Siva1O54926 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Siva1O54926 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Siva1O54926 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Siva1O54926 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Siva1O54926 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Siva1O54926 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Siva1O54926 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Siva1O54926 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Siva1O54926 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Siva1O54926 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms