Protein–RNA interactions for Protein: J3QME6

Lipo1, Lipase, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lipo1J3QME6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lipo1J3QME6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lipo1J3QME6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Lipo1J3QME6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lipo1J3QME6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lipo1J3QME6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lipo1J3QME6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lipo1J3QME6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lipo1J3QME6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lipo1J3QME6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lipo1J3QME6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lipo1J3QME6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lipo1J3QME6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lipo1J3QME6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lipo1J3QME6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lipo1J3QME6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lipo1J3QME6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Lipo1J3QME6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lipo1J3QME6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lipo1J3QME6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lipo1J3QME6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lipo1J3QME6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lipo1J3QME6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lipo1J3QME6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lipo1J3QME6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lipo1J3QME6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lipo1J3QME6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lipo1J3QME6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lipo1J3QME6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Lipo1J3QME6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lipo1J3QME6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lipo1J3QME6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Lipo1J3QME6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Lipo1J3QME6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lipo1J3QME6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lipo1J3QME6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Lipo1J3QME6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lipo1J3QME6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Lipo1J3QME6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lipo1J3QME6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lipo1J3QME6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lipo1J3QME6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Lipo1J3QME6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lipo1J3QME6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Lipo1J3QME6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lipo1J3QME6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lipo1J3QME6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lipo1J3QME6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lipo1J3QME6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lipo1J3QME6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lipo1J3QME6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lipo1J3QME6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lipo1J3QME6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lipo1J3QME6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lipo1J3QME6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lipo1J3QME6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lipo1J3QME6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lipo1J3QME6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lipo1J3QME6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lipo1J3QME6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lipo1J3QME6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lipo1J3QME6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lipo1J3QME6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lipo1J3QME6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lipo1J3QME6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lipo1J3QME6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lipo1J3QME6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lipo1J3QME6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lipo1J3QME6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lipo1J3QME6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lipo1J3QME6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lipo1J3QME6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lipo1J3QME6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lipo1J3QME6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Lipo1J3QME6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lipo1J3QME6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lipo1J3QME6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lipo1J3QME6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lipo1J3QME6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lipo1J3QME6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lipo1J3QME6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lipo1J3QME6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lipo1J3QME6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lipo1J3QME6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lipo1J3QME6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lipo1J3QME6 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lipo1J3QME6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lipo1J3QME6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lipo1J3QME6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lipo1J3QME6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lipo1J3QME6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lipo1J3QME6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lipo1J3QME6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lipo1J3QME6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lipo1J3QME6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lipo1J3QME6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lipo1J3QME6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lipo1J3QME6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lipo1J3QME6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lipo1J3QME6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms