Protein–RNA interactions for Protein: E9PXM3

Vmn1r177, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r177E9PXM3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vmn1r177E9PXM3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vmn1r177E9PXM3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vmn1r177E9PXM3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vmn1r177E9PXM3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vmn1r177E9PXM3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r177E9PXM3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r177E9PXM3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r177E9PXM3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r177E9PXM3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r177E9PXM3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r177E9PXM3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r177E9PXM3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r177E9PXM3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r177E9PXM3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r177E9PXM3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r177E9PXM3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r177E9PXM3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r177E9PXM3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r177E9PXM3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r177E9PXM3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r177E9PXM3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r177E9PXM3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r177E9PXM3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r177E9PXM3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r177E9PXM3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r177E9PXM3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r177E9PXM3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r177E9PXM3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r177E9PXM3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r177E9PXM3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r177E9PXM3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r177E9PXM3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r177E9PXM3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r177E9PXM3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r177E9PXM3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r177E9PXM3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r177E9PXM3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r177E9PXM3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r177E9PXM3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r177E9PXM3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r177E9PXM3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r177E9PXM3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r177E9PXM3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r177E9PXM3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r177E9PXM3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r177E9PXM3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r177E9PXM3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r177E9PXM3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r177E9PXM3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r177E9PXM3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r177E9PXM3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r177E9PXM3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r177E9PXM3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r177E9PXM3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r177E9PXM3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r177E9PXM3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r177E9PXM3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r177E9PXM3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r177E9PXM3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r177E9PXM3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r177E9PXM3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r177E9PXM3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r177E9PXM3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r177E9PXM3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r177E9PXM3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r177E9PXM3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r177E9PXM3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r177E9PXM3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r177E9PXM3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r177E9PXM3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r177E9PXM3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r177E9PXM3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r177E9PXM3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r177E9PXM3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r177E9PXM3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Vmn1r177E9PXM3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r177E9PXM3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r177E9PXM3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r177E9PXM3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r177E9PXM3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r177E9PXM3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r177E9PXM3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r177E9PXM3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r177E9PXM3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r177E9PXM3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r177E9PXM3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r177E9PXM3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r177E9PXM3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r177E9PXM3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r177E9PXM3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r177E9PXM3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r177E9PXM3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r177E9PXM3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r177E9PXM3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r177E9PXM3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r177E9PXM3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r177E9PXM3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r177E9PXM3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r177E9PXM3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms