Protein–RNA interactions for Protein: E9PV26

Prr36, Proline-rich 36, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr36E9PV26 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Prr36E9PV26 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Prr36E9PV26 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prr36E9PV26 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Prr36E9PV26 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prr36E9PV26 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prr36E9PV26 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prr36E9PV26 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prr36E9PV26 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prr36E9PV26 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prr36E9PV26 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prr36E9PV26 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prr36E9PV26 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prr36E9PV26 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prr36E9PV26 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prr36E9PV26 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prr36E9PV26 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prr36E9PV26 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prr36E9PV26 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prr36E9PV26 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Prr36E9PV26 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Prr36E9PV26 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prr36E9PV26 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prr36E9PV26 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prr36E9PV26 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prr36E9PV26 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prr36E9PV26 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prr36E9PV26 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prr36E9PV26 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prr36E9PV26 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prr36E9PV26 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prr36E9PV26 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prr36E9PV26 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prr36E9PV26 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prr36E9PV26 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prr36E9PV26 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prr36E9PV26 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prr36E9PV26 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prr36E9PV26 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prr36E9PV26 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prr36E9PV26 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prr36E9PV26 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prr36E9PV26 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prr36E9PV26 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prr36E9PV26 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prr36E9PV26 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prr36E9PV26 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prr36E9PV26 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prr36E9PV26 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prr36E9PV26 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prr36E9PV26 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prr36E9PV26 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prr36E9PV26 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prr36E9PV26 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prr36E9PV26 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Prr36E9PV26 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prr36E9PV26 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prr36E9PV26 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prr36E9PV26 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prr36E9PV26 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prr36E9PV26 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prr36E9PV26 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prr36E9PV26 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prr36E9PV26 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prr36E9PV26 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prr36E9PV26 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prr36E9PV26 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prr36E9PV26 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prr36E9PV26 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prr36E9PV26 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prr36E9PV26 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prr36E9PV26 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prr36E9PV26 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prr36E9PV26 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prr36E9PV26 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prr36E9PV26 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prr36E9PV26 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prr36E9PV26 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prr36E9PV26 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prr36E9PV26 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prr36E9PV26 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prr36E9PV26 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prr36E9PV26 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prr36E9PV26 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prr36E9PV26 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prr36E9PV26 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prr36E9PV26 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prr36E9PV26 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prr36E9PV26 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prr36E9PV26 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prr36E9PV26 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prr36E9PV26 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prr36E9PV26 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prr36E9PV26 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Prr36E9PV26 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prr36E9PV26 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prr36E9PV26 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prr36E9PV26 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prr36E9PV26 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Prr36E9PV26 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms