Protein–RNA interactions for Protein: C9JLJ4

USP17L13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L13C9JLJ4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP17L13C9JLJ4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP17L13C9JLJ4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP17L13C9JLJ4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP17L13C9JLJ4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP17L13C9JLJ4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP17L13C9JLJ4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP17L13C9JLJ4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP17L13C9JLJ4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP17L13C9JLJ4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP17L13C9JLJ4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
USP17L13C9JLJ4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP17L13C9JLJ4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP17L13C9JLJ4 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
USP17L13C9JLJ4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP17L13C9JLJ4 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP17L13C9JLJ4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP17L13C9JLJ4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP17L13C9JLJ4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP17L13C9JLJ4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP17L13C9JLJ4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP17L13C9JLJ4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP17L13C9JLJ4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP17L13C9JLJ4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP17L13C9JLJ4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP17L13C9JLJ4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP17L13C9JLJ4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP17L13C9JLJ4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP17L13C9JLJ4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP17L13C9JLJ4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP17L13C9JLJ4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP17L13C9JLJ4 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP17L13C9JLJ4 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP17L13C9JLJ4 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP17L13C9JLJ4 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
USP17L13C9JLJ4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
USP17L13C9JLJ4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
USP17L13C9JLJ4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP17L13C9JLJ4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP17L13C9JLJ4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP17L13C9JLJ4 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
USP17L13C9JLJ4 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP17L13C9JLJ4 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP17L13C9JLJ4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP17L13C9JLJ4 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP17L13C9JLJ4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP17L13C9JLJ4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP17L13C9JLJ4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP17L13C9JLJ4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP17L13C9JLJ4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP17L13C9JLJ4 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
USP17L13C9JLJ4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP17L13C9JLJ4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
USP17L13C9JLJ4 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
USP17L13C9JLJ4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP17L13C9JLJ4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP17L13C9JLJ4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP17L13C9JLJ4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP17L13C9JLJ4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP17L13C9JLJ4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP17L13C9JLJ4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP17L13C9JLJ4 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP17L13C9JLJ4 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP17L13C9JLJ4 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP17L13C9JLJ4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP17L13C9JLJ4 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP17L13C9JLJ4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP17L13C9JLJ4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
USP17L13C9JLJ4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP17L13C9JLJ4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP17L13C9JLJ4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP17L13C9JLJ4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP17L13C9JLJ4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP17L13C9JLJ4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP17L13C9JLJ4 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP17L13C9JLJ4 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP17L13C9JLJ4 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP17L13C9JLJ4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP17L13C9JLJ4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP17L13C9JLJ4 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP17L13C9JLJ4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP17L13C9JLJ4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP17L13C9JLJ4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP17L13C9JLJ4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP17L13C9JLJ4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP17L13C9JLJ4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP17L13C9JLJ4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP17L13C9JLJ4 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP17L13C9JLJ4 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP17L13C9JLJ4 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP17L13C9JLJ4 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP17L13C9JLJ4 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP17L13C9JLJ4 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
USP17L13C9JLJ4 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP17L13C9JLJ4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
USP17L13C9JLJ4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
USP17L13C9JLJ4 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
USP17L13C9JLJ4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP17L13C9JLJ4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP17L13C9JLJ4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms