Protein–RNA interactions for Protein: B3KS81

SRRM5, Serine/arginine repetitive matrix protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM5B3KS81 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SRRM5B3KS81 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRRM5B3KS81 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRRM5B3KS81 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRRM5B3KS81 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SRRM5B3KS81 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRRM5B3KS81 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SRRM5B3KS81 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRRM5B3KS81 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRRM5B3KS81 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRRM5B3KS81 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRRM5B3KS81 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRRM5B3KS81 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SRRM5B3KS81 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRRM5B3KS81 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRRM5B3KS81 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRRM5B3KS81 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRRM5B3KS81 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SRRM5B3KS81 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms