Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Calcoco2A2A6M5 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Calcoco2A2A6M5 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Calcoco2A2A6M5 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Calcoco2A2A6M5 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Calcoco2A2A6M5 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Calcoco2A2A6M5 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Calcoco2A2A6M5 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Calcoco2A2A6M5 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Calcoco2A2A6M5 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Calcoco2A2A6M5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Calcoco2A2A6M5 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Calcoco2A2A6M5 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Calcoco2A2A6M5 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Calcoco2A2A6M5 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Calcoco2A2A6M5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Calcoco2A2A6M5 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Calcoco2A2A6M5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Calcoco2A2A6M5 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Calcoco2A2A6M5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Calcoco2A2A6M5 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Calcoco2A2A6M5 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Calcoco2A2A6M5 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Calcoco2A2A6M5 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Calcoco2A2A6M5 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Calcoco2A2A6M5 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Calcoco2A2A6M5 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Calcoco2A2A6M5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Calcoco2A2A6M5 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Calcoco2A2A6M5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Calcoco2A2A6M5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Calcoco2A2A6M5 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Calcoco2A2A6M5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Calcoco2A2A6M5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Calcoco2A2A6M5 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Calcoco2A2A6M5 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Calcoco2A2A6M5 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Calcoco2A2A6M5 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Calcoco2A2A6M5 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Calcoco2A2A6M5 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Calcoco2A2A6M5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Calcoco2A2A6M5 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Calcoco2A2A6M5 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Calcoco2A2A6M5 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Calcoco2A2A6M5 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Calcoco2A2A6M5 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Calcoco2A2A6M5 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Calcoco2A2A6M5 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Calcoco2A2A6M5 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Calcoco2A2A6M5 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Calcoco2A2A6M5 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Calcoco2A2A6M5 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Calcoco2A2A6M5 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Calcoco2A2A6M5 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Calcoco2A2A6M5 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Calcoco2A2A6M5 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Calcoco2A2A6M5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Calcoco2A2A6M5 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Calcoco2A2A6M5 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Calcoco2A2A6M5 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Calcoco2A2A6M5 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Calcoco2A2A6M5 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Calcoco2A2A6M5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Calcoco2A2A6M5 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Calcoco2A2A6M5 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Calcoco2A2A6M5 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Calcoco2A2A6M5 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Calcoco2A2A6M5 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Calcoco2A2A6M5 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Calcoco2A2A6M5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Calcoco2A2A6M5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Calcoco2A2A6M5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Calcoco2A2A6M5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Calcoco2A2A6M5 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Calcoco2A2A6M5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Calcoco2A2A6M5 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Calcoco2A2A6M5 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Calcoco2A2A6M5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Calcoco2A2A6M5 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Calcoco2A2A6M5 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Calcoco2A2A6M5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Calcoco2A2A6M5 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Calcoco2A2A6M5 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Calcoco2A2A6M5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Calcoco2A2A6M5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Calcoco2A2A6M5 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Calcoco2A2A6M5 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Calcoco2A2A6M5 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Calcoco2A2A6M5 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Calcoco2A2A6M5 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Calcoco2A2A6M5 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Calcoco2A2A6M5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Calcoco2A2A6M5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Calcoco2A2A6M5 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Calcoco2A2A6M5 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Calcoco2A2A6M5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Calcoco2A2A6M5 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Calcoco2A2A6M5 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Calcoco2A2A6M5 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Calcoco2A2A6M5 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms