Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Homer1Q9Z2Y3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Homer1Q9Z2Y3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Homer1Q9Z2Y3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Homer1Q9Z2Y3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Homer1Q9Z2Y3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Homer1Q9Z2Y3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Homer1Q9Z2Y3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Homer1Q9Z2Y3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Homer1Q9Z2Y3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Homer1Q9Z2Y3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Homer1Q9Z2Y3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Homer1Q9Z2Y3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Homer1Q9Z2Y3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Homer1Q9Z2Y3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Homer1Q9Z2Y3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Homer1Q9Z2Y3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Homer1Q9Z2Y3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Homer1Q9Z2Y3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Homer1Q9Z2Y3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Homer1Q9Z2Y3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Homer1Q9Z2Y3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Homer1Q9Z2Y3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Homer1Q9Z2Y3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Homer1Q9Z2Y3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Homer1Q9Z2Y3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Homer1Q9Z2Y3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Homer1Q9Z2Y3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Homer1Q9Z2Y3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Homer1Q9Z2Y3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Homer1Q9Z2Y3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Homer1Q9Z2Y3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Homer1Q9Z2Y3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Homer1Q9Z2Y3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Homer1Q9Z2Y3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Homer1Q9Z2Y3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Homer1Q9Z2Y3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Homer1Q9Z2Y3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Homer1Q9Z2Y3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Homer1Q9Z2Y3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Homer1Q9Z2Y3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Homer1Q9Z2Y3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Homer1Q9Z2Y3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Homer1Q9Z2Y3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Homer1Q9Z2Y3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Homer1Q9Z2Y3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Homer1Q9Z2Y3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Homer1Q9Z2Y3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Homer1Q9Z2Y3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Homer1Q9Z2Y3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Homer1Q9Z2Y3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Homer1Q9Z2Y3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Homer1Q9Z2Y3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Homer1Q9Z2Y3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Homer1Q9Z2Y3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Homer1Q9Z2Y3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Homer1Q9Z2Y3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Homer1Q9Z2Y3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Homer1Q9Z2Y3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Homer1Q9Z2Y3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Homer1Q9Z2Y3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Homer1Q9Z2Y3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Homer1Q9Z2Y3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Homer1Q9Z2Y3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Homer1Q9Z2Y3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Homer1Q9Z2Y3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Homer1Q9Z2Y3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Homer1Q9Z2Y3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Homer1Q9Z2Y3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Homer1Q9Z2Y3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Homer1Q9Z2Y3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Homer1Q9Z2Y3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Homer1Q9Z2Y3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Homer1Q9Z2Y3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Homer1Q9Z2Y3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Homer1Q9Z2Y3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Homer1Q9Z2Y3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Homer1Q9Z2Y3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Homer1Q9Z2Y3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Homer1Q9Z2Y3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Homer1Q9Z2Y3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Homer1Q9Z2Y3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Homer1Q9Z2Y3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Homer1Q9Z2Y3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Homer1Q9Z2Y3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Homer1Q9Z2Y3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Homer1Q9Z2Y3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Homer1Q9Z2Y3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Homer1Q9Z2Y3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Homer1Q9Z2Y3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Homer1Q9Z2Y3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Homer1Q9Z2Y3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Homer1Q9Z2Y3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Homer1Q9Z2Y3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Homer1Q9Z2Y3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Homer1Q9Z2Y3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Homer1Q9Z2Y3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Homer1Q9Z2Y3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Homer1Q9Z2Y3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Homer1Q9Z2Y3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms