Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D6

ARFGEF1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF1Q9Y6D6 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARFGEF1Q9Y6D6 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARFGEF1Q9Y6D6 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARFGEF1Q9Y6D6 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARFGEF1Q9Y6D6 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARFGEF1Q9Y6D6 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARFGEF1Q9Y6D6 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ARFGEF1Q9Y6D6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
ARFGEF1Q9Y6D6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARFGEF1Q9Y6D6 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARFGEF1Q9Y6D6 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARFGEF1Q9Y6D6 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARFGEF1Q9Y6D6 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARFGEF1Q9Y6D6 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARFGEF1Q9Y6D6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARFGEF1Q9Y6D6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARFGEF1Q9Y6D6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARFGEF1Q9Y6D6 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
ARFGEF1Q9Y6D6 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
ARFGEF1Q9Y6D6 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
ARFGEF1Q9Y6D6 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
ARFGEF1Q9Y6D6 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
ARFGEF1Q9Y6D6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARFGEF1Q9Y6D6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
ARFGEF1Q9Y6D6 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARFGEF1Q9Y6D6 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARFGEF1Q9Y6D6 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARFGEF1Q9Y6D6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARFGEF1Q9Y6D6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARFGEF1Q9Y6D6 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARFGEF1Q9Y6D6 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARFGEF1Q9Y6D6 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARFGEF1Q9Y6D6 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ARFGEF1Q9Y6D6 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ARFGEF1Q9Y6D6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ARFGEF1Q9Y6D6 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARFGEF1Q9Y6D6 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARFGEF1Q9Y6D6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARFGEF1Q9Y6D6 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARFGEF1Q9Y6D6 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARFGEF1Q9Y6D6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARFGEF1Q9Y6D6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARFGEF1Q9Y6D6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARFGEF1Q9Y6D6 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARFGEF1Q9Y6D6 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARFGEF1Q9Y6D6 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARFGEF1Q9Y6D6 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARFGEF1Q9Y6D6 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARFGEF1Q9Y6D6 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARFGEF1Q9Y6D6 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARFGEF1Q9Y6D6 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ARFGEF1Q9Y6D6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARFGEF1Q9Y6D6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARFGEF1Q9Y6D6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARFGEF1Q9Y6D6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARFGEF1Q9Y6D6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARFGEF1Q9Y6D6 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARFGEF1Q9Y6D6 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARFGEF1Q9Y6D6 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARFGEF1Q9Y6D6 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARFGEF1Q9Y6D6 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARFGEF1Q9Y6D6 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARFGEF1Q9Y6D6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARFGEF1Q9Y6D6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARFGEF1Q9Y6D6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARFGEF1Q9Y6D6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARFGEF1Q9Y6D6 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARFGEF1Q9Y6D6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARFGEF1Q9Y6D6 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARFGEF1Q9Y6D6 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARFGEF1Q9Y6D6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARFGEF1Q9Y6D6 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
ARFGEF1Q9Y6D6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARFGEF1Q9Y6D6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARFGEF1Q9Y6D6 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARFGEF1Q9Y6D6 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
ARFGEF1Q9Y6D6 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARFGEF1Q9Y6D6 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARFGEF1Q9Y6D6 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ARFGEF1Q9Y6D6 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ARFGEF1Q9Y6D6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ARFGEF1Q9Y6D6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ARFGEF1Q9Y6D6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ARFGEF1Q9Y6D6 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ARFGEF1Q9Y6D6 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
ARFGEF1Q9Y6D6 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ARFGEF1Q9Y6D6 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ARFGEF1Q9Y6D6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ARFGEF1Q9Y6D6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ARFGEF1Q9Y6D6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ARFGEF1Q9Y6D6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ARFGEF1Q9Y6D6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ARFGEF1Q9Y6D6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ARFGEF1Q9Y6D6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ARFGEF1Q9Y6D6 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARFGEF1Q9Y6D6 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARFGEF1Q9Y6D6 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARFGEF1Q9Y6D6 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARFGEF1Q9Y6D6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARFGEF1Q9Y6D6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms