Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X0

MED16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, humanhuman

Predictions only

Length 877 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED16Q9Y2X0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MED16Q9Y2X0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MED16Q9Y2X0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MED16Q9Y2X0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MED16Q9Y2X0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MED16Q9Y2X0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MED16Q9Y2X0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MED16Q9Y2X0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MED16Q9Y2X0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MED16Q9Y2X0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MED16Q9Y2X0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
MED16Q9Y2X0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MED16Q9Y2X0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MED16Q9Y2X0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MED16Q9Y2X0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MED16Q9Y2X0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MED16Q9Y2X0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MED16Q9Y2X0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MED16Q9Y2X0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MED16Q9Y2X0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MED16Q9Y2X0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MED16Q9Y2X0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
MED16Q9Y2X0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MED16Q9Y2X0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MED16Q9Y2X0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MED16Q9Y2X0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
MED16Q9Y2X0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MED16Q9Y2X0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MED16Q9Y2X0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MED16Q9Y2X0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MED16Q9Y2X0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MED16Q9Y2X0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MED16Q9Y2X0 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MED16Q9Y2X0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MED16Q9Y2X0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MED16Q9Y2X0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MED16Q9Y2X0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MED16Q9Y2X0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MED16Q9Y2X0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MED16Q9Y2X0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MED16Q9Y2X0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MED16Q9Y2X0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MED16Q9Y2X0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MED16Q9Y2X0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MED16Q9Y2X0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MED16Q9Y2X0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MED16Q9Y2X0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.31■■□□□ 1
MED16Q9Y2X0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MED16Q9Y2X0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MED16Q9Y2X0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MED16Q9Y2X0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MED16Q9Y2X0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MED16Q9Y2X0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
MED16Q9Y2X0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MED16Q9Y2X0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MED16Q9Y2X0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MED16Q9Y2X0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MED16Q9Y2X0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MED16Q9Y2X0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
MED16Q9Y2X0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
MED16Q9Y2X0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MED16Q9Y2X0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MED16Q9Y2X0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MED16Q9Y2X0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MED16Q9Y2X0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MED16Q9Y2X0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MED16Q9Y2X0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MED16Q9Y2X0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MED16Q9Y2X0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MED16Q9Y2X0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MED16Q9Y2X0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MED16Q9Y2X0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MED16Q9Y2X0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MED16Q9Y2X0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MED16Q9Y2X0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MED16Q9Y2X0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MED16Q9Y2X0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MED16Q9Y2X0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MED16Q9Y2X0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MED16Q9Y2X0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
MED16Q9Y2X0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MED16Q9Y2X0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MED16Q9Y2X0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MED16Q9Y2X0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MED16Q9Y2X0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MED16Q9Y2X0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MED16Q9Y2X0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MED16Q9Y2X0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MED16Q9Y2X0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MED16Q9Y2X0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MED16Q9Y2X0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MED16Q9Y2X0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MED16Q9Y2X0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MED16Q9Y2X0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MED16Q9Y2X0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MED16Q9Y2X0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MED16Q9Y2X0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MED16Q9Y2X0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MED16Q9Y2X0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MED16Q9Y2X0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms