Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y259

CHKB, Choline/ethanolamine kinase, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKBQ9Y259 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHKBQ9Y259 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHKBQ9Y259 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHKBQ9Y259 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHKBQ9Y259 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHKBQ9Y259 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHKBQ9Y259 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHKBQ9Y259 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CHKBQ9Y259 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHKBQ9Y259 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHKBQ9Y259 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CHKBQ9Y259 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHKBQ9Y259 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHKBQ9Y259 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHKBQ9Y259 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHKBQ9Y259 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHKBQ9Y259 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHKBQ9Y259 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHKBQ9Y259 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHKBQ9Y259 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHKBQ9Y259 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHKBQ9Y259 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHKBQ9Y259 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHKBQ9Y259 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHKBQ9Y259 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHKBQ9Y259 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHKBQ9Y259 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHKBQ9Y259 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHKBQ9Y259 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHKBQ9Y259 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHKBQ9Y259 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHKBQ9Y259 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHKBQ9Y259 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CHKBQ9Y259 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CHKBQ9Y259 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CHKBQ9Y259 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHKBQ9Y259 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHKBQ9Y259 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHKBQ9Y259 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHKBQ9Y259 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHKBQ9Y259 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHKBQ9Y259 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHKBQ9Y259 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHKBQ9Y259 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CHKBQ9Y259 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CHKBQ9Y259 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHKBQ9Y259 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHKBQ9Y259 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHKBQ9Y259 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CHKBQ9Y259 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHKBQ9Y259 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHKBQ9Y259 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHKBQ9Y259 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHKBQ9Y259 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHKBQ9Y259 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHKBQ9Y259 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHKBQ9Y259 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHKBQ9Y259 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHKBQ9Y259 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHKBQ9Y259 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHKBQ9Y259 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHKBQ9Y259 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CHKBQ9Y259 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHKBQ9Y259 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHKBQ9Y259 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CHKBQ9Y259 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CHKBQ9Y259 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHKBQ9Y259 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHKBQ9Y259 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHKBQ9Y259 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHKBQ9Y259 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHKBQ9Y259 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHKBQ9Y259 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHKBQ9Y259 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHKBQ9Y259 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHKBQ9Y259 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CHKBQ9Y259 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHKBQ9Y259 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CHKBQ9Y259 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CHKBQ9Y259 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHKBQ9Y259 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHKBQ9Y259 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHKBQ9Y259 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHKBQ9Y259 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHKBQ9Y259 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHKBQ9Y259 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CHKBQ9Y259 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHKBQ9Y259 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHKBQ9Y259 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHKBQ9Y259 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CHKBQ9Y259 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CHKBQ9Y259 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHKBQ9Y259 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHKBQ9Y259 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHKBQ9Y259 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHKBQ9Y259 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHKBQ9Y259 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHKBQ9Y259 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHKBQ9Y259 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHKBQ9Y259 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms