Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTNAP2Q9UHC6 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTNAP2Q9UHC6 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTNAP2Q9UHC6 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTNAP2Q9UHC6 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTNAP2Q9UHC6 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTNAP2Q9UHC6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTNAP2Q9UHC6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTNAP2Q9UHC6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTNAP2Q9UHC6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTNAP2Q9UHC6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTNAP2Q9UHC6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNTNAP2Q9UHC6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTNAP2Q9UHC6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTNAP2Q9UHC6 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTNAP2Q9UHC6 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTNAP2Q9UHC6 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTNAP2Q9UHC6 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTNAP2Q9UHC6 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTNAP2Q9UHC6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTNAP2Q9UHC6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTNAP2Q9UHC6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTNAP2Q9UHC6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTNAP2Q9UHC6 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTNAP2Q9UHC6 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNTNAP2Q9UHC6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTNAP2Q9UHC6 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTNAP2Q9UHC6 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTNAP2Q9UHC6 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTNAP2Q9UHC6 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTNAP2Q9UHC6 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTNAP2Q9UHC6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTNAP2Q9UHC6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTNAP2Q9UHC6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTNAP2Q9UHC6 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTNAP2Q9UHC6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTNAP2Q9UHC6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTNAP2Q9UHC6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTNAP2Q9UHC6 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTNAP2Q9UHC6 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTNAP2Q9UHC6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTNAP2Q9UHC6 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTNAP2Q9UHC6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTNAP2Q9UHC6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTNAP2Q9UHC6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTNAP2Q9UHC6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CNTNAP2Q9UHC6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
CNTNAP2Q9UHC6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CNTNAP2Q9UHC6 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CNTNAP2Q9UHC6 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CNTNAP2Q9UHC6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CNTNAP2Q9UHC6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CNTNAP2Q9UHC6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNTNAP2Q9UHC6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNTNAP2Q9UHC6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNTNAP2Q9UHC6 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNTNAP2Q9UHC6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTNAP2Q9UHC6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTNAP2Q9UHC6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTNAP2Q9UHC6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTNAP2Q9UHC6 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTNAP2Q9UHC6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTNAP2Q9UHC6 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTNAP2Q9UHC6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTNAP2Q9UHC6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTNAP2Q9UHC6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTNAP2Q9UHC6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTNAP2Q9UHC6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTNAP2Q9UHC6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTNAP2Q9UHC6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTNAP2Q9UHC6 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTNAP2Q9UHC6 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTNAP2Q9UHC6 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTNAP2Q9UHC6 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTNAP2Q9UHC6 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTNAP2Q9UHC6 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTNAP2Q9UHC6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTNAP2Q9UHC6 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTNAP2Q9UHC6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTNAP2Q9UHC6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTNAP2Q9UHC6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTNAP2Q9UHC6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTNAP2Q9UHC6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTNAP2Q9UHC6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTNAP2Q9UHC6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTNAP2Q9UHC6 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTNAP2Q9UHC6 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTNAP2Q9UHC6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTNAP2Q9UHC6 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTNAP2Q9UHC6 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTNAP2Q9UHC6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTNAP2Q9UHC6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTNAP2Q9UHC6 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTNAP2Q9UHC6 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTNAP2Q9UHC6 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTNAP2Q9UHC6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms