Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK8

MTRR, Methionine synthase reductase, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRRQ9UBK8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MTRRQ9UBK8 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MTRRQ9UBK8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MTRRQ9UBK8 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MTRRQ9UBK8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MTRRQ9UBK8 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MTRRQ9UBK8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MTRRQ9UBK8 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MTRRQ9UBK8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MTRRQ9UBK8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MTRRQ9UBK8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MTRRQ9UBK8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MTRRQ9UBK8 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MTRRQ9UBK8 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MTRRQ9UBK8 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MTRRQ9UBK8 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MTRRQ9UBK8 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MTRRQ9UBK8 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MTRRQ9UBK8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MTRRQ9UBK8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MTRRQ9UBK8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MTRRQ9UBK8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MTRRQ9UBK8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MTRRQ9UBK8 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MTRRQ9UBK8 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MTRRQ9UBK8 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MTRRQ9UBK8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MTRRQ9UBK8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MTRRQ9UBK8 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MTRRQ9UBK8 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MTRRQ9UBK8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MTRRQ9UBK8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MTRRQ9UBK8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MTRRQ9UBK8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MTRRQ9UBK8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MTRRQ9UBK8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MTRRQ9UBK8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MTRRQ9UBK8 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MTRRQ9UBK8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MTRRQ9UBK8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MTRRQ9UBK8 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MTRRQ9UBK8 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MTRRQ9UBK8 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MTRRQ9UBK8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MTRRQ9UBK8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MTRRQ9UBK8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MTRRQ9UBK8 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MTRRQ9UBK8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MTRRQ9UBK8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MTRRQ9UBK8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MTRRQ9UBK8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MTRRQ9UBK8 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MTRRQ9UBK8 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MTRRQ9UBK8 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MTRRQ9UBK8 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MTRRQ9UBK8 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MTRRQ9UBK8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MTRRQ9UBK8 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MTRRQ9UBK8 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MTRRQ9UBK8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MTRRQ9UBK8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MTRRQ9UBK8 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MTRRQ9UBK8 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MTRRQ9UBK8 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MTRRQ9UBK8 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MTRRQ9UBK8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MTRRQ9UBK8 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MTRRQ9UBK8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MTRRQ9UBK8 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MTRRQ9UBK8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MTRRQ9UBK8 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MTRRQ9UBK8 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MTRRQ9UBK8 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MTRRQ9UBK8 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MTRRQ9UBK8 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MTRRQ9UBK8 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MTRRQ9UBK8 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MTRRQ9UBK8 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MTRRQ9UBK8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MTRRQ9UBK8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MTRRQ9UBK8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MTRRQ9UBK8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTRRQ9UBK8 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTRRQ9UBK8 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTRRQ9UBK8 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTRRQ9UBK8 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTRRQ9UBK8 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTRRQ9UBK8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTRRQ9UBK8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTRRQ9UBK8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTRRQ9UBK8 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTRRQ9UBK8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTRRQ9UBK8 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTRRQ9UBK8 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTRRQ9UBK8 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTRRQ9UBK8 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTRRQ9UBK8 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTRRQ9UBK8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MTRRQ9UBK8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MTRRQ9UBK8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms