Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TDP1Q9NUW8 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TDP1Q9NUW8 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TDP1Q9NUW8 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TDP1Q9NUW8 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TDP1Q9NUW8 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TDP1Q9NUW8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TDP1Q9NUW8 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TDP1Q9NUW8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TDP1Q9NUW8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TDP1Q9NUW8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TDP1Q9NUW8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TDP1Q9NUW8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TDP1Q9NUW8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TDP1Q9NUW8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TDP1Q9NUW8 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TDP1Q9NUW8 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TDP1Q9NUW8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TDP1Q9NUW8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TDP1Q9NUW8 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TDP1Q9NUW8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TDP1Q9NUW8 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TDP1Q9NUW8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TDP1Q9NUW8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TDP1Q9NUW8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TDP1Q9NUW8 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TDP1Q9NUW8 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TDP1Q9NUW8 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TDP1Q9NUW8 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TDP1Q9NUW8 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TDP1Q9NUW8 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TDP1Q9NUW8 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TDP1Q9NUW8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TDP1Q9NUW8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TDP1Q9NUW8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TDP1Q9NUW8 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TDP1Q9NUW8 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TDP1Q9NUW8 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TDP1Q9NUW8 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TDP1Q9NUW8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TDP1Q9NUW8 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDP1Q9NUW8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDP1Q9NUW8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDP1Q9NUW8 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDP1Q9NUW8 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDP1Q9NUW8 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TDP1Q9NUW8 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDP1Q9NUW8 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDP1Q9NUW8 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDP1Q9NUW8 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDP1Q9NUW8 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDP1Q9NUW8 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDP1Q9NUW8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDP1Q9NUW8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDP1Q9NUW8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TDP1Q9NUW8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TDP1Q9NUW8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TDP1Q9NUW8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TDP1Q9NUW8 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TDP1Q9NUW8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TDP1Q9NUW8 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TDP1Q9NUW8 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TDP1Q9NUW8 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TDP1Q9NUW8 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TDP1Q9NUW8 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TDP1Q9NUW8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TDP1Q9NUW8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TDP1Q9NUW8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TDP1Q9NUW8 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TDP1Q9NUW8 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TDP1Q9NUW8 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TDP1Q9NUW8 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TDP1Q9NUW8 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TDP1Q9NUW8 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TDP1Q9NUW8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TDP1Q9NUW8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TDP1Q9NUW8 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TDP1Q9NUW8 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TDP1Q9NUW8 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TDP1Q9NUW8 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TDP1Q9NUW8 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TDP1Q9NUW8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TDP1Q9NUW8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TDP1Q9NUW8 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TDP1Q9NUW8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TDP1Q9NUW8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TDP1Q9NUW8 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TDP1Q9NUW8 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TDP1Q9NUW8 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TDP1Q9NUW8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TDP1Q9NUW8 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TDP1Q9NUW8 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TDP1Q9NUW8 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TDP1Q9NUW8 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TDP1Q9NUW8 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TDP1Q9NUW8 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TDP1Q9NUW8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TDP1Q9NUW8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TDP1Q9NUW8 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TDP1Q9NUW8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
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