Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CIPCQ9C0C6 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CIPCQ9C0C6 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CIPCQ9C0C6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CIPCQ9C0C6 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CIPCQ9C0C6 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CIPCQ9C0C6 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CIPCQ9C0C6 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CIPCQ9C0C6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CIPCQ9C0C6 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CIPCQ9C0C6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CIPCQ9C0C6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CIPCQ9C0C6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CIPCQ9C0C6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CIPCQ9C0C6 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CIPCQ9C0C6 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CIPCQ9C0C6 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CIPCQ9C0C6 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CIPCQ9C0C6 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CIPCQ9C0C6 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CIPCQ9C0C6 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CIPCQ9C0C6 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CIPCQ9C0C6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CIPCQ9C0C6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CIPCQ9C0C6 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CIPCQ9C0C6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CIPCQ9C0C6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CIPCQ9C0C6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CIPCQ9C0C6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CIPCQ9C0C6 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CIPCQ9C0C6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CIPCQ9C0C6 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CIPCQ9C0C6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CIPCQ9C0C6 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CIPCQ9C0C6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CIPCQ9C0C6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CIPCQ9C0C6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CIPCQ9C0C6 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CIPCQ9C0C6 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CIPCQ9C0C6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CIPCQ9C0C6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CIPCQ9C0C6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CIPCQ9C0C6 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CIPCQ9C0C6 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CIPCQ9C0C6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CIPCQ9C0C6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CIPCQ9C0C6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CIPCQ9C0C6 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CIPCQ9C0C6 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CIPCQ9C0C6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CIPCQ9C0C6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CIPCQ9C0C6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CIPCQ9C0C6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CIPCQ9C0C6 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CIPCQ9C0C6 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CIPCQ9C0C6 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CIPCQ9C0C6 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CIPCQ9C0C6 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CIPCQ9C0C6 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CIPCQ9C0C6 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CIPCQ9C0C6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CIPCQ9C0C6 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CIPCQ9C0C6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CIPCQ9C0C6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CIPCQ9C0C6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CIPCQ9C0C6 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CIPCQ9C0C6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CIPCQ9C0C6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CIPCQ9C0C6 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CIPCQ9C0C6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CIPCQ9C0C6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CIPCQ9C0C6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CIPCQ9C0C6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CIPCQ9C0C6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CIPCQ9C0C6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CIPCQ9C0C6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CIPCQ9C0C6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CIPCQ9C0C6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CIPCQ9C0C6 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CIPCQ9C0C6 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CIPCQ9C0C6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CIPCQ9C0C6 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CIPCQ9C0C6 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CIPCQ9C0C6 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CIPCQ9C0C6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CIPCQ9C0C6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CIPCQ9C0C6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CIPCQ9C0C6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CIPCQ9C0C6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CIPCQ9C0C6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CIPCQ9C0C6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CIPCQ9C0C6 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CIPCQ9C0C6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CIPCQ9C0C6 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CIPCQ9C0C6 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CIPCQ9C0C6 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CIPCQ9C0C6 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CIPCQ9C0C6 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CIPCQ9C0C6 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CIPCQ9C0C6 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms