Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY71

LRRC3, Leucine-rich repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC3Q9BY71 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC3Q9BY71 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC3Q9BY71 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC3Q9BY71 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC3Q9BY71 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC3Q9BY71 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC3Q9BY71 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC3Q9BY71 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC3Q9BY71 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC3Q9BY71 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC3Q9BY71 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC3Q9BY71 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC3Q9BY71 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC3Q9BY71 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC3Q9BY71 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC3Q9BY71 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC3Q9BY71 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC3Q9BY71 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC3Q9BY71 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC3Q9BY71 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC3Q9BY71 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC3Q9BY71 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC3Q9BY71 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC3Q9BY71 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC3Q9BY71 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC3Q9BY71 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC3Q9BY71 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC3Q9BY71 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC3Q9BY71 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC3Q9BY71 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC3Q9BY71 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC3Q9BY71 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC3Q9BY71 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC3Q9BY71 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC3Q9BY71 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC3Q9BY71 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC3Q9BY71 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC3Q9BY71 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC3Q9BY71 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC3Q9BY71 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC3Q9BY71 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC3Q9BY71 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC3Q9BY71 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC3Q9BY71 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC3Q9BY71 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC3Q9BY71 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC3Q9BY71 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC3Q9BY71 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC3Q9BY71 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC3Q9BY71 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC3Q9BY71 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC3Q9BY71 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC3Q9BY71 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC3Q9BY71 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC3Q9BY71 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC3Q9BY71 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC3Q9BY71 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC3Q9BY71 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC3Q9BY71 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC3Q9BY71 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC3Q9BY71 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC3Q9BY71 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC3Q9BY71 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC3Q9BY71 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC3Q9BY71 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC3Q9BY71 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC3Q9BY71 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC3Q9BY71 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC3Q9BY71 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC3Q9BY71 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC3Q9BY71 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC3Q9BY71 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC3Q9BY71 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC3Q9BY71 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC3Q9BY71 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC3Q9BY71 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC3Q9BY71 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC3Q9BY71 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC3Q9BY71 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC3Q9BY71 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC3Q9BY71 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC3Q9BY71 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC3Q9BY71 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC3Q9BY71 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC3Q9BY71 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC3Q9BY71 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LRRC3Q9BY71 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC3Q9BY71 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC3Q9BY71 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC3Q9BY71 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC3Q9BY71 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC3Q9BY71 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC3Q9BY71 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC3Q9BY71 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC3Q9BY71 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC3Q9BY71 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC3Q9BY71 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC3Q9BY71 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC3Q9BY71 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC3Q9BY71 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms