Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVC3

DSCC1, Sister chromatid cohesion protein DCC1, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSCC1Q9BVC3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DSCC1Q9BVC3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DSCC1Q9BVC3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DSCC1Q9BVC3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DSCC1Q9BVC3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DSCC1Q9BVC3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DSCC1Q9BVC3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DSCC1Q9BVC3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DSCC1Q9BVC3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DSCC1Q9BVC3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DSCC1Q9BVC3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DSCC1Q9BVC3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DSCC1Q9BVC3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
DSCC1Q9BVC3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DSCC1Q9BVC3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DSCC1Q9BVC3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DSCC1Q9BVC3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DSCC1Q9BVC3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DSCC1Q9BVC3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DSCC1Q9BVC3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DSCC1Q9BVC3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DSCC1Q9BVC3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DSCC1Q9BVC3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DSCC1Q9BVC3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DSCC1Q9BVC3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DSCC1Q9BVC3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DSCC1Q9BVC3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DSCC1Q9BVC3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DSCC1Q9BVC3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DSCC1Q9BVC3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DSCC1Q9BVC3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DSCC1Q9BVC3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DSCC1Q9BVC3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DSCC1Q9BVC3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DSCC1Q9BVC3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DSCC1Q9BVC3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DSCC1Q9BVC3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DSCC1Q9BVC3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DSCC1Q9BVC3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DSCC1Q9BVC3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
DSCC1Q9BVC3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DSCC1Q9BVC3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DSCC1Q9BVC3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
DSCC1Q9BVC3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DSCC1Q9BVC3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DSCC1Q9BVC3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DSCC1Q9BVC3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DSCC1Q9BVC3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DSCC1Q9BVC3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DSCC1Q9BVC3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DSCC1Q9BVC3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DSCC1Q9BVC3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DSCC1Q9BVC3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DSCC1Q9BVC3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DSCC1Q9BVC3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DSCC1Q9BVC3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DSCC1Q9BVC3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DSCC1Q9BVC3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DSCC1Q9BVC3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DSCC1Q9BVC3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DSCC1Q9BVC3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DSCC1Q9BVC3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DSCC1Q9BVC3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DSCC1Q9BVC3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DSCC1Q9BVC3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DSCC1Q9BVC3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DSCC1Q9BVC3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DSCC1Q9BVC3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
DSCC1Q9BVC3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
DSCC1Q9BVC3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DSCC1Q9BVC3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DSCC1Q9BVC3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DSCC1Q9BVC3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DSCC1Q9BVC3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
DSCC1Q9BVC3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DSCC1Q9BVC3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DSCC1Q9BVC3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DSCC1Q9BVC3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DSCC1Q9BVC3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
DSCC1Q9BVC3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DSCC1Q9BVC3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DSCC1Q9BVC3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DSCC1Q9BVC3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DSCC1Q9BVC3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DSCC1Q9BVC3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DSCC1Q9BVC3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
DSCC1Q9BVC3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DSCC1Q9BVC3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DSCC1Q9BVC3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DSCC1Q9BVC3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DSCC1Q9BVC3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DSCC1Q9BVC3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DSCC1Q9BVC3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DSCC1Q9BVC3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DSCC1Q9BVC3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DSCC1Q9BVC3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DSCC1Q9BVC3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DSCC1Q9BVC3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DSCC1Q9BVC3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DSCC1Q9BVC3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms