Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT88

SYT11, Synaptotagmin-11, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT11Q9BT88 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYT11Q9BT88 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SYT11Q9BT88 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYT11Q9BT88 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYT11Q9BT88 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SYT11Q9BT88 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYT11Q9BT88 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYT11Q9BT88 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYT11Q9BT88 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYT11Q9BT88 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYT11Q9BT88 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYT11Q9BT88 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYT11Q9BT88 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYT11Q9BT88 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SYT11Q9BT88 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SYT11Q9BT88 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SYT11Q9BT88 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYT11Q9BT88 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SYT11Q9BT88 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23■■□□□ 1.27
SYT11Q9BT88 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SYT11Q9BT88 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SYT11Q9BT88 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SYT11Q9BT88 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYT11Q9BT88 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYT11Q9BT88 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYT11Q9BT88 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYT11Q9BT88 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SYT11Q9BT88 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SYT11Q9BT88 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYT11Q9BT88 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYT11Q9BT88 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYT11Q9BT88 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYT11Q9BT88 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYT11Q9BT88 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYT11Q9BT88 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYT11Q9BT88 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYT11Q9BT88 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYT11Q9BT88 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYT11Q9BT88 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYT11Q9BT88 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYT11Q9BT88 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYT11Q9BT88 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYT11Q9BT88 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYT11Q9BT88 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYT11Q9BT88 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYT11Q9BT88 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYT11Q9BT88 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYT11Q9BT88 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYT11Q9BT88 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYT11Q9BT88 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYT11Q9BT88 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYT11Q9BT88 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYT11Q9BT88 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYT11Q9BT88 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYT11Q9BT88 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYT11Q9BT88 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYT11Q9BT88 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYT11Q9BT88 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYT11Q9BT88 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYT11Q9BT88 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYT11Q9BT88 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYT11Q9BT88 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYT11Q9BT88 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYT11Q9BT88 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYT11Q9BT88 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYT11Q9BT88 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYT11Q9BT88 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYT11Q9BT88 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYT11Q9BT88 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYT11Q9BT88 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYT11Q9BT88 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYT11Q9BT88 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYT11Q9BT88 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYT11Q9BT88 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYT11Q9BT88 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYT11Q9BT88 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYT11Q9BT88 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYT11Q9BT88 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYT11Q9BT88 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYT11Q9BT88 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYT11Q9BT88 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYT11Q9BT88 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYT11Q9BT88 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYT11Q9BT88 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYT11Q9BT88 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SYT11Q9BT88 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYT11Q9BT88 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYT11Q9BT88 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYT11Q9BT88 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYT11Q9BT88 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYT11Q9BT88 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYT11Q9BT88 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYT11Q9BT88 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYT11Q9BT88 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYT11Q9BT88 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SYT11Q9BT88 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYT11Q9BT88 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYT11Q9BT88 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYT11Q9BT88 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYT11Q9BT88 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms