Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD3

KXD1, KxDL motif-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KXD1Q9BQD3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KXD1Q9BQD3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KXD1Q9BQD3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KXD1Q9BQD3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KXD1Q9BQD3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KXD1Q9BQD3 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KXD1Q9BQD3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KXD1Q9BQD3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KXD1Q9BQD3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KXD1Q9BQD3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KXD1Q9BQD3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KXD1Q9BQD3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KXD1Q9BQD3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KXD1Q9BQD3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KXD1Q9BQD3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KXD1Q9BQD3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KXD1Q9BQD3 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KXD1Q9BQD3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KXD1Q9BQD3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KXD1Q9BQD3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KXD1Q9BQD3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KXD1Q9BQD3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KXD1Q9BQD3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KXD1Q9BQD3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KXD1Q9BQD3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KXD1Q9BQD3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KXD1Q9BQD3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KXD1Q9BQD3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KXD1Q9BQD3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KXD1Q9BQD3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KXD1Q9BQD3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KXD1Q9BQD3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KXD1Q9BQD3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KXD1Q9BQD3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KXD1Q9BQD3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KXD1Q9BQD3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KXD1Q9BQD3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KXD1Q9BQD3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KXD1Q9BQD3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KXD1Q9BQD3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KXD1Q9BQD3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KXD1Q9BQD3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KXD1Q9BQD3 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KXD1Q9BQD3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KXD1Q9BQD3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KXD1Q9BQD3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KXD1Q9BQD3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KXD1Q9BQD3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KXD1Q9BQD3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KXD1Q9BQD3 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KXD1Q9BQD3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KXD1Q9BQD3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KXD1Q9BQD3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KXD1Q9BQD3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KXD1Q9BQD3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KXD1Q9BQD3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KXD1Q9BQD3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KXD1Q9BQD3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KXD1Q9BQD3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KXD1Q9BQD3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KXD1Q9BQD3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KXD1Q9BQD3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KXD1Q9BQD3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KXD1Q9BQD3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KXD1Q9BQD3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KXD1Q9BQD3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KXD1Q9BQD3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KXD1Q9BQD3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KXD1Q9BQD3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KXD1Q9BQD3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KXD1Q9BQD3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KXD1Q9BQD3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KXD1Q9BQD3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KXD1Q9BQD3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KXD1Q9BQD3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KXD1Q9BQD3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KXD1Q9BQD3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KXD1Q9BQD3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KXD1Q9BQD3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KXD1Q9BQD3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KXD1Q9BQD3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KXD1Q9BQD3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KXD1Q9BQD3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KXD1Q9BQD3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KXD1Q9BQD3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KXD1Q9BQD3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KXD1Q9BQD3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KXD1Q9BQD3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KXD1Q9BQD3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KXD1Q9BQD3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KXD1Q9BQD3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KXD1Q9BQD3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KXD1Q9BQD3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KXD1Q9BQD3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KXD1Q9BQD3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KXD1Q9BQD3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KXD1Q9BQD3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KXD1Q9BQD3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KXD1Q9BQD3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KXD1Q9BQD3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms