Protein–RNA interactions for Protein: Q99PS0

Krt23, Keratin, type I cytoskeletal 23, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt23Q99PS0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Krt23Q99PS0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krt23Q99PS0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krt23Q99PS0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krt23Q99PS0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krt23Q99PS0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krt23Q99PS0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krt23Q99PS0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krt23Q99PS0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krt23Q99PS0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krt23Q99PS0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Krt23Q99PS0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Krt23Q99PS0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Krt23Q99PS0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Krt23Q99PS0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Krt23Q99PS0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Krt23Q99PS0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Krt23Q99PS0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Krt23Q99PS0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Krt23Q99PS0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Krt23Q99PS0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Krt23Q99PS0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Krt23Q99PS0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt23Q99PS0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt23Q99PS0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt23Q99PS0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt23Q99PS0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt23Q99PS0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt23Q99PS0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt23Q99PS0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt23Q99PS0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krt23Q99PS0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt23Q99PS0 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt23Q99PS0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt23Q99PS0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt23Q99PS0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt23Q99PS0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt23Q99PS0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt23Q99PS0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt23Q99PS0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt23Q99PS0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt23Q99PS0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt23Q99PS0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt23Q99PS0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt23Q99PS0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt23Q99PS0 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt23Q99PS0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt23Q99PS0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt23Q99PS0 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krt23Q99PS0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Krt23Q99PS0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Krt23Q99PS0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Krt23Q99PS0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Krt23Q99PS0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Krt23Q99PS0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Krt23Q99PS0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Krt23Q99PS0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Krt23Q99PS0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt23Q99PS0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt23Q99PS0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt23Q99PS0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt23Q99PS0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt23Q99PS0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt23Q99PS0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt23Q99PS0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt23Q99PS0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt23Q99PS0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt23Q99PS0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt23Q99PS0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt23Q99PS0 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt23Q99PS0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt23Q99PS0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt23Q99PS0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krt23Q99PS0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt23Q99PS0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt23Q99PS0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt23Q99PS0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt23Q99PS0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt23Q99PS0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt23Q99PS0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt23Q99PS0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt23Q99PS0 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt23Q99PS0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt23Q99PS0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt23Q99PS0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt23Q99PS0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt23Q99PS0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Krt23Q99PS0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Krt23Q99PS0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Krt23Q99PS0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Krt23Q99PS0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Krt23Q99PS0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Krt23Q99PS0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Krt23Q99PS0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Krt23Q99PS0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Krt23Q99PS0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Krt23Q99PS0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Krt23Q99PS0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Krt23Q99PS0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Krt23Q99PS0 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms