Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apobec3Q99J72 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apobec3Q99J72 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apobec3Q99J72 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apobec3Q99J72 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apobec3Q99J72 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apobec3Q99J72 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apobec3Q99J72 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apobec3Q99J72 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apobec3Q99J72 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apobec3Q99J72 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Apobec3Q99J72 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Apobec3Q99J72 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Apobec3Q99J72 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Apobec3Q99J72 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Apobec3Q99J72 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Apobec3Q99J72 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Apobec3Q99J72 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Apobec3Q99J72 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Apobec3Q99J72 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Apobec3Q99J72 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Apobec3Q99J72 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Apobec3Q99J72 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Apobec3Q99J72 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Apobec3Q99J72 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Apobec3Q99J72 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Apobec3Q99J72 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Apobec3Q99J72 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Apobec3Q99J72 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Apobec3Q99J72 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Apobec3Q99J72 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Apobec3Q99J72 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Apobec3Q99J72 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Apobec3Q99J72 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Apobec3Q99J72 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Apobec3Q99J72 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Apobec3Q99J72 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Apobec3Q99J72 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Apobec3Q99J72 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Apobec3Q99J72 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Apobec3Q99J72 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Apobec3Q99J72 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Apobec3Q99J72 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Apobec3Q99J72 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Apobec3Q99J72 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Apobec3Q99J72 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Apobec3Q99J72 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Apobec3Q99J72 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Apobec3Q99J72 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Apobec3Q99J72 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Apobec3Q99J72 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Apobec3Q99J72 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Apobec3Q99J72 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Apobec3Q99J72 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Apobec3Q99J72 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Apobec3Q99J72 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apobec3Q99J72 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apobec3Q99J72 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apobec3Q99J72 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apobec3Q99J72 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Apobec3Q99J72 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Apobec3Q99J72 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Apobec3Q99J72 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apobec3Q99J72 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apobec3Q99J72 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apobec3Q99J72 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apobec3Q99J72 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apobec3Q99J72 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apobec3Q99J72 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apobec3Q99J72 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apobec3Q99J72 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Apobec3Q99J72 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Apobec3Q99J72 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apobec3Q99J72 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Apobec3Q99J72 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apobec3Q99J72 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apobec3Q99J72 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apobec3Q99J72 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apobec3Q99J72 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apobec3Q99J72 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apobec3Q99J72 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apobec3Q99J72 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apobec3Q99J72 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Apobec3Q99J72 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apobec3Q99J72 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apobec3Q99J72 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apobec3Q99J72 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Apobec3Q99J72 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Apobec3Q99J72 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Apobec3Q99J72 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Apobec3Q99J72 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Apobec3Q99J72 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Apobec3Q99J72 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Apobec3Q99J72 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Apobec3Q99J72 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Apobec3Q99J72 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Apobec3Q99J72 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Apobec3Q99J72 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Apobec3Q99J72 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Apobec3Q99J72 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms