Protein–RNA interactions for Protein: Q96QV1

HHIP, Hedgehog-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHIPQ96QV1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HHIPQ96QV1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HHIPQ96QV1 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HHIPQ96QV1 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HHIPQ96QV1 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HHIPQ96QV1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HHIPQ96QV1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HHIPQ96QV1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HHIPQ96QV1 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HHIPQ96QV1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HHIPQ96QV1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HHIPQ96QV1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
HHIPQ96QV1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HHIPQ96QV1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HHIPQ96QV1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HHIPQ96QV1 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HHIPQ96QV1 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HHIPQ96QV1 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HHIPQ96QV1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HHIPQ96QV1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HHIPQ96QV1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HHIPQ96QV1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HHIPQ96QV1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HHIPQ96QV1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HHIPQ96QV1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HHIPQ96QV1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HHIPQ96QV1 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HHIPQ96QV1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HHIPQ96QV1 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HHIPQ96QV1 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HHIPQ96QV1 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HHIPQ96QV1 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HHIPQ96QV1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HHIPQ96QV1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HHIPQ96QV1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HHIPQ96QV1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HHIPQ96QV1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HHIPQ96QV1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HHIPQ96QV1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HHIPQ96QV1 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HHIPQ96QV1 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HHIPQ96QV1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HHIPQ96QV1 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HHIPQ96QV1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HHIPQ96QV1 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
HHIPQ96QV1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HHIPQ96QV1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HHIPQ96QV1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HHIPQ96QV1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HHIPQ96QV1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HHIPQ96QV1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HHIPQ96QV1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
HHIPQ96QV1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HHIPQ96QV1 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HHIPQ96QV1 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HHIPQ96QV1 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HHIPQ96QV1 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HHIPQ96QV1 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
HHIPQ96QV1 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HHIPQ96QV1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HHIPQ96QV1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HHIPQ96QV1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HHIPQ96QV1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HHIPQ96QV1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
HHIPQ96QV1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HHIPQ96QV1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HHIPQ96QV1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HHIPQ96QV1 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HHIPQ96QV1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HHIPQ96QV1 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HHIPQ96QV1 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HHIPQ96QV1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HHIPQ96QV1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HHIPQ96QV1 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HHIPQ96QV1 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HHIPQ96QV1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HHIPQ96QV1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HHIPQ96QV1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HHIPQ96QV1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HHIPQ96QV1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HHIPQ96QV1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HHIPQ96QV1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HHIPQ96QV1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HHIPQ96QV1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HHIPQ96QV1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HHIPQ96QV1 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HHIPQ96QV1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HHIPQ96QV1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HHIPQ96QV1 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HHIPQ96QV1 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
HHIPQ96QV1 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
HHIPQ96QV1 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
HHIPQ96QV1 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HHIPQ96QV1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HHIPQ96QV1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HHIPQ96QV1 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HHIPQ96QV1 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HHIPQ96QV1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HHIPQ96QV1 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HHIPQ96QV1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
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