Protein–RNA interactions for Protein: Q96CG8

CTHRC1, Collagen triple helix repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTHRC1Q96CG8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTHRC1Q96CG8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTHRC1Q96CG8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTHRC1Q96CG8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTHRC1Q96CG8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTHRC1Q96CG8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTHRC1Q96CG8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTHRC1Q96CG8 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTHRC1Q96CG8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTHRC1Q96CG8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTHRC1Q96CG8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTHRC1Q96CG8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTHRC1Q96CG8 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTHRC1Q96CG8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTHRC1Q96CG8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTHRC1Q96CG8 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTHRC1Q96CG8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTHRC1Q96CG8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTHRC1Q96CG8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTHRC1Q96CG8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTHRC1Q96CG8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTHRC1Q96CG8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTHRC1Q96CG8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTHRC1Q96CG8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTHRC1Q96CG8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTHRC1Q96CG8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTHRC1Q96CG8 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTHRC1Q96CG8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTHRC1Q96CG8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTHRC1Q96CG8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTHRC1Q96CG8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTHRC1Q96CG8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTHRC1Q96CG8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTHRC1Q96CG8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTHRC1Q96CG8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTHRC1Q96CG8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTHRC1Q96CG8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTHRC1Q96CG8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTHRC1Q96CG8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTHRC1Q96CG8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTHRC1Q96CG8 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTHRC1Q96CG8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTHRC1Q96CG8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTHRC1Q96CG8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTHRC1Q96CG8 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTHRC1Q96CG8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTHRC1Q96CG8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTHRC1Q96CG8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTHRC1Q96CG8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTHRC1Q96CG8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTHRC1Q96CG8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTHRC1Q96CG8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTHRC1Q96CG8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTHRC1Q96CG8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTHRC1Q96CG8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTHRC1Q96CG8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CTHRC1Q96CG8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTHRC1Q96CG8 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTHRC1Q96CG8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTHRC1Q96CG8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTHRC1Q96CG8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTHRC1Q96CG8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTHRC1Q96CG8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTHRC1Q96CG8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTHRC1Q96CG8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTHRC1Q96CG8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTHRC1Q96CG8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTHRC1Q96CG8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTHRC1Q96CG8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTHRC1Q96CG8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTHRC1Q96CG8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTHRC1Q96CG8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTHRC1Q96CG8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CTHRC1Q96CG8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTHRC1Q96CG8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTHRC1Q96CG8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTHRC1Q96CG8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTHRC1Q96CG8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTHRC1Q96CG8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTHRC1Q96CG8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTHRC1Q96CG8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTHRC1Q96CG8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTHRC1Q96CG8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTHRC1Q96CG8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTHRC1Q96CG8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTHRC1Q96CG8 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CTHRC1Q96CG8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTHRC1Q96CG8 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTHRC1Q96CG8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTHRC1Q96CG8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTHRC1Q96CG8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTHRC1Q96CG8 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CTHRC1Q96CG8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTHRC1Q96CG8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTHRC1Q96CG8 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CTHRC1Q96CG8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTHRC1Q96CG8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTHRC1Q96CG8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTHRC1Q96CG8 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CTHRC1Q96CG8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms