Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00612Q8N6U2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms