Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0S2

SYCE1, Synaptonemal complex central element protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE1Q8N0S2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCE1Q8N0S2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCE1Q8N0S2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCE1Q8N0S2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCE1Q8N0S2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCE1Q8N0S2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCE1Q8N0S2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCE1Q8N0S2 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCE1Q8N0S2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCE1Q8N0S2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCE1Q8N0S2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCE1Q8N0S2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCE1Q8N0S2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCE1Q8N0S2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCE1Q8N0S2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCE1Q8N0S2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCE1Q8N0S2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCE1Q8N0S2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCE1Q8N0S2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCE1Q8N0S2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCE1Q8N0S2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCE1Q8N0S2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCE1Q8N0S2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCE1Q8N0S2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCE1Q8N0S2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCE1Q8N0S2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCE1Q8N0S2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCE1Q8N0S2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCE1Q8N0S2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCE1Q8N0S2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCE1Q8N0S2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCE1Q8N0S2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCE1Q8N0S2 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCE1Q8N0S2 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCE1Q8N0S2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCE1Q8N0S2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCE1Q8N0S2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCE1Q8N0S2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCE1Q8N0S2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCE1Q8N0S2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCE1Q8N0S2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCE1Q8N0S2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCE1Q8N0S2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCE1Q8N0S2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCE1Q8N0S2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCE1Q8N0S2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCE1Q8N0S2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYCE1Q8N0S2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCE1Q8N0S2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCE1Q8N0S2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCE1Q8N0S2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCE1Q8N0S2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCE1Q8N0S2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCE1Q8N0S2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCE1Q8N0S2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCE1Q8N0S2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYCE1Q8N0S2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCE1Q8N0S2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCE1Q8N0S2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCE1Q8N0S2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCE1Q8N0S2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCE1Q8N0S2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCE1Q8N0S2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCE1Q8N0S2 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCE1Q8N0S2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCE1Q8N0S2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCE1Q8N0S2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCE1Q8N0S2 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCE1Q8N0S2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCE1Q8N0S2 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCE1Q8N0S2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYCE1Q8N0S2 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCE1Q8N0S2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCE1Q8N0S2 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCE1Q8N0S2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCE1Q8N0S2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCE1Q8N0S2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCE1Q8N0S2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCE1Q8N0S2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCE1Q8N0S2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCE1Q8N0S2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCE1Q8N0S2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCE1Q8N0S2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCE1Q8N0S2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCE1Q8N0S2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCE1Q8N0S2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCE1Q8N0S2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCE1Q8N0S2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCE1Q8N0S2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCE1Q8N0S2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCE1Q8N0S2 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCE1Q8N0S2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCE1Q8N0S2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCE1Q8N0S2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCE1Q8N0S2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCE1Q8N0S2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCE1Q8N0S2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCE1Q8N0S2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCE1Q8N0S2 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCE1Q8N0S2 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms