Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLF2Q8IX21 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLF2Q8IX21 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SLF2Q8IX21 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SLF2Q8IX21 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLF2Q8IX21 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLF2Q8IX21 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLF2Q8IX21 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLF2Q8IX21 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLF2Q8IX21 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLF2Q8IX21 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLF2Q8IX21 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLF2Q8IX21 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLF2Q8IX21 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLF2Q8IX21 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLF2Q8IX21 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLF2Q8IX21 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SLF2Q8IX21 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLF2Q8IX21 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLF2Q8IX21 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLF2Q8IX21 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SLF2Q8IX21 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SLF2Q8IX21 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLF2Q8IX21 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLF2Q8IX21 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLF2Q8IX21 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SLF2Q8IX21 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLF2Q8IX21 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SLF2Q8IX21 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLF2Q8IX21 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLF2Q8IX21 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLF2Q8IX21 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SLF2Q8IX21 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLF2Q8IX21 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLF2Q8IX21 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLF2Q8IX21 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLF2Q8IX21 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLF2Q8IX21 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLF2Q8IX21 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLF2Q8IX21 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SLF2Q8IX21 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLF2Q8IX21 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLF2Q8IX21 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLF2Q8IX21 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLF2Q8IX21 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLF2Q8IX21 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLF2Q8IX21 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLF2Q8IX21 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SLF2Q8IX21 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLF2Q8IX21 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLF2Q8IX21 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLF2Q8IX21 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLF2Q8IX21 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLF2Q8IX21 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLF2Q8IX21 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLF2Q8IX21 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLF2Q8IX21 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLF2Q8IX21 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLF2Q8IX21 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLF2Q8IX21 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLF2Q8IX21 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLF2Q8IX21 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLF2Q8IX21 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLF2Q8IX21 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLF2Q8IX21 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLF2Q8IX21 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLF2Q8IX21 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLF2Q8IX21 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLF2Q8IX21 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLF2Q8IX21 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLF2Q8IX21 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLF2Q8IX21 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLF2Q8IX21 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLF2Q8IX21 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLF2Q8IX21 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLF2Q8IX21 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLF2Q8IX21 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLF2Q8IX21 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLF2Q8IX21 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLF2Q8IX21 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLF2Q8IX21 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLF2Q8IX21 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLF2Q8IX21 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLF2Q8IX21 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLF2Q8IX21 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLF2Q8IX21 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLF2Q8IX21 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLF2Q8IX21 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SLF2Q8IX21 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLF2Q8IX21 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLF2Q8IX21 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLF2Q8IX21 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SLF2Q8IX21 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLF2Q8IX21 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLF2Q8IX21 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLF2Q8IX21 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLF2Q8IX21 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLF2Q8IX21 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLF2Q8IX21 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLF2Q8IX21 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms