Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEJ8

Gm9955, Predicted gene 9955 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9955Q8CEJ8 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm9955Q8CEJ8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm9955Q8CEJ8 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm9955Q8CEJ8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm9955Q8CEJ8 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm9955Q8CEJ8 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm9955Q8CEJ8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm9955Q8CEJ8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
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Gm9955Q8CEJ8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm9955Q8CEJ8 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm9955Q8CEJ8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
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Gm9955Q8CEJ8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm9955Q8CEJ8 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm9955Q8CEJ8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
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Gm9955Q8CEJ8 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
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Gm9955Q8CEJ8 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm9955Q8CEJ8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm9955Q8CEJ8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
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Gm9955Q8CEJ8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
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Gm9955Q8CEJ8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
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Gm9955Q8CEJ8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm9955Q8CEJ8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
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Gm9955Q8CEJ8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm9955Q8CEJ8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm9955Q8CEJ8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm9955Q8CEJ8 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm9955Q8CEJ8 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
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Gm9955Q8CEJ8 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
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Gm9955Q8CEJ8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm9955Q8CEJ8 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm9955Q8CEJ8 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Gm9955Q8CEJ8 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
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Gm9955Q8CEJ8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
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Gm9955Q8CEJ8 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
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Gm9955Q8CEJ8 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
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Gm9955Q8CEJ8 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm9955Q8CEJ8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm9955Q8CEJ8 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Gm9955Q8CEJ8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm9955Q8CEJ8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm9955Q8CEJ8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm9955Q8CEJ8 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm9955Q8CEJ8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm9955Q8CEJ8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm9955Q8CEJ8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm9955Q8CEJ8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm9955Q8CEJ8 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm9955Q8CEJ8 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm9955Q8CEJ8 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm9955Q8CEJ8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm9955Q8CEJ8 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm9955Q8CEJ8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Gm9955Q8CEJ8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
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Gm9955Q8CEJ8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
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Gm9955Q8CEJ8 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms