Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHJ7

Gabra5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra5Q8BHJ7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gabra5Q8BHJ7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gabra5Q8BHJ7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gabra5Q8BHJ7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gabra5Q8BHJ7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gabra5Q8BHJ7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gabra5Q8BHJ7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gabra5Q8BHJ7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gabra5Q8BHJ7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gabra5Q8BHJ7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Gabra5Q8BHJ7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gabra5Q8BHJ7 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gabra5Q8BHJ7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gabra5Q8BHJ7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gabra5Q8BHJ7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gabra5Q8BHJ7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gabra5Q8BHJ7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gabra5Q8BHJ7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gabra5Q8BHJ7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gabra5Q8BHJ7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gabra5Q8BHJ7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gabra5Q8BHJ7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gabra5Q8BHJ7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gabra5Q8BHJ7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gabra5Q8BHJ7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gabra5Q8BHJ7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Gabra5Q8BHJ7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gabra5Q8BHJ7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gabra5Q8BHJ7 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gabra5Q8BHJ7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gabra5Q8BHJ7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gabra5Q8BHJ7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gabra5Q8BHJ7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Gabra5Q8BHJ7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gabra5Q8BHJ7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gabra5Q8BHJ7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gabra5Q8BHJ7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gabra5Q8BHJ7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gabra5Q8BHJ7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gabra5Q8BHJ7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gabra5Q8BHJ7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gabra5Q8BHJ7 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gabra5Q8BHJ7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gabra5Q8BHJ7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Gabra5Q8BHJ7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gabra5Q8BHJ7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gabra5Q8BHJ7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gabra5Q8BHJ7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gabra5Q8BHJ7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gabra5Q8BHJ7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gabra5Q8BHJ7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gabra5Q8BHJ7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gabra5Q8BHJ7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gabra5Q8BHJ7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Gabra5Q8BHJ7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gabra5Q8BHJ7 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gabra5Q8BHJ7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Gabra5Q8BHJ7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gabra5Q8BHJ7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gabra5Q8BHJ7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gabra5Q8BHJ7 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gabra5Q8BHJ7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gabra5Q8BHJ7 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gabra5Q8BHJ7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gabra5Q8BHJ7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gabra5Q8BHJ7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gabra5Q8BHJ7 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gabra5Q8BHJ7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Gabra5Q8BHJ7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gabra5Q8BHJ7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gabra5Q8BHJ7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gabra5Q8BHJ7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gabra5Q8BHJ7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gabra5Q8BHJ7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gabra5Q8BHJ7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gabra5Q8BHJ7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gabra5Q8BHJ7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gabra5Q8BHJ7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gabra5Q8BHJ7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gabra5Q8BHJ7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gabra5Q8BHJ7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gabra5Q8BHJ7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gabra5Q8BHJ7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gabra5Q8BHJ7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gabra5Q8BHJ7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gabra5Q8BHJ7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gabra5Q8BHJ7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gabra5Q8BHJ7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gabra5Q8BHJ7 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gabra5Q8BHJ7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gabra5Q8BHJ7 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gabra5Q8BHJ7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gabra5Q8BHJ7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gabra5Q8BHJ7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gabra5Q8BHJ7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Gabra5Q8BHJ7 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gabra5Q8BHJ7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gabra5Q8BHJ7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gabra5Q8BHJ7 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gabra5Q8BHJ7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms