Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMM8

Parp16, Mono [ADP-ribose] polymerase PARP16, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp16Q7TMM8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Parp16Q7TMM8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Parp16Q7TMM8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Parp16Q7TMM8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Parp16Q7TMM8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Parp16Q7TMM8 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Parp16Q7TMM8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Parp16Q7TMM8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp16Q7TMM8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp16Q7TMM8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp16Q7TMM8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp16Q7TMM8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp16Q7TMM8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp16Q7TMM8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp16Q7TMM8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp16Q7TMM8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp16Q7TMM8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp16Q7TMM8 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Parp16Q7TMM8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Parp16Q7TMM8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Parp16Q7TMM8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Parp16Q7TMM8 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Parp16Q7TMM8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Parp16Q7TMM8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Parp16Q7TMM8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Parp16Q7TMM8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Parp16Q7TMM8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Parp16Q7TMM8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Parp16Q7TMM8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Parp16Q7TMM8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Parp16Q7TMM8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Parp16Q7TMM8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Parp16Q7TMM8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Parp16Q7TMM8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Parp16Q7TMM8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Parp16Q7TMM8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Parp16Q7TMM8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Parp16Q7TMM8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Parp16Q7TMM8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Parp16Q7TMM8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Parp16Q7TMM8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Parp16Q7TMM8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Parp16Q7TMM8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Parp16Q7TMM8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Parp16Q7TMM8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Parp16Q7TMM8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Parp16Q7TMM8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Parp16Q7TMM8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Parp16Q7TMM8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Parp16Q7TMM8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Parp16Q7TMM8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Parp16Q7TMM8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Parp16Q7TMM8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Parp16Q7TMM8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Parp16Q7TMM8 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Parp16Q7TMM8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Parp16Q7TMM8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Parp16Q7TMM8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Parp16Q7TMM8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Parp16Q7TMM8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Parp16Q7TMM8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Parp16Q7TMM8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Parp16Q7TMM8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Parp16Q7TMM8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Parp16Q7TMM8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Parp16Q7TMM8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Parp16Q7TMM8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Parp16Q7TMM8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Parp16Q7TMM8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Parp16Q7TMM8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Parp16Q7TMM8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Parp16Q7TMM8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Parp16Q7TMM8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Parp16Q7TMM8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Parp16Q7TMM8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Parp16Q7TMM8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Parp16Q7TMM8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Parp16Q7TMM8 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Parp16Q7TMM8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Parp16Q7TMM8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Parp16Q7TMM8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Parp16Q7TMM8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Parp16Q7TMM8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Parp16Q7TMM8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Parp16Q7TMM8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Parp16Q7TMM8 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Parp16Q7TMM8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Parp16Q7TMM8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Parp16Q7TMM8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Parp16Q7TMM8 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Parp16Q7TMM8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Parp16Q7TMM8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Parp16Q7TMM8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Parp16Q7TMM8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Parp16Q7TMM8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Parp16Q7TMM8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Parp16Q7TMM8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Parp16Q7TMM8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Parp16Q7TMM8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Parp16Q7TMM8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms