Protein–RNA interactions for Protein: Q6X893

Slc44a1, Choline transporter-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a1Q6X893 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc44a1Q6X893 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc44a1Q6X893 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc44a1Q6X893 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc44a1Q6X893 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc44a1Q6X893 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc44a1Q6X893 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc44a1Q6X893 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc44a1Q6X893 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc44a1Q6X893 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc44a1Q6X893 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc44a1Q6X893 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc44a1Q6X893 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc44a1Q6X893 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc44a1Q6X893 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc44a1Q6X893 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc44a1Q6X893 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc44a1Q6X893 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc44a1Q6X893 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc44a1Q6X893 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc44a1Q6X893 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc44a1Q6X893 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc44a1Q6X893 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc44a1Q6X893 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc44a1Q6X893 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc44a1Q6X893 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc44a1Q6X893 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc44a1Q6X893 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc44a1Q6X893 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc44a1Q6X893 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc44a1Q6X893 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc44a1Q6X893 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc44a1Q6X893 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc44a1Q6X893 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc44a1Q6X893 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc44a1Q6X893 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc44a1Q6X893 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc44a1Q6X893 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc44a1Q6X893 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc44a1Q6X893 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc44a1Q6X893 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc44a1Q6X893 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc44a1Q6X893 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc44a1Q6X893 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc44a1Q6X893 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc44a1Q6X893 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc44a1Q6X893 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc44a1Q6X893 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc44a1Q6X893 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc44a1Q6X893 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc44a1Q6X893 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc44a1Q6X893 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc44a1Q6X893 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc44a1Q6X893 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc44a1Q6X893 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc44a1Q6X893 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc44a1Q6X893 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc44a1Q6X893 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc44a1Q6X893 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc44a1Q6X893 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc44a1Q6X893 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc44a1Q6X893 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc44a1Q6X893 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc44a1Q6X893 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc44a1Q6X893 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Slc44a1Q6X893 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc44a1Q6X893 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc44a1Q6X893 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc44a1Q6X893 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc44a1Q6X893 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc44a1Q6X893 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc44a1Q6X893 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc44a1Q6X893 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc44a1Q6X893 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc44a1Q6X893 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc44a1Q6X893 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc44a1Q6X893 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc44a1Q6X893 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc44a1Q6X893 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc44a1Q6X893 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc44a1Q6X893 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc44a1Q6X893 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc44a1Q6X893 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc44a1Q6X893 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc44a1Q6X893 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc44a1Q6X893 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc44a1Q6X893 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc44a1Q6X893 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc44a1Q6X893 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc44a1Q6X893 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc44a1Q6X893 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc44a1Q6X893 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc44a1Q6X893 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc44a1Q6X893 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc44a1Q6X893 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc44a1Q6X893 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc44a1Q6X893 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc44a1Q6X893 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc44a1Q6X893 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc44a1Q6X893 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms